Hier presenteren we een protocol ter voorbereiding van de DNA-monsters van het voedsel en milieu microbiomes voor gezamenlijke detectie en subtypering van Salmonella via quasimetagenomic sequencing. Het gecombineerd gebruik van cultuur verrijking, immunomagnetic scheiding (IMS) en meerdere verplaatsing mogelijk versterking (MDA) van de effectieve concentratie van Salmonella genomic DNA van voedsel en milieu monsters.