I denne protokol introducerer vi en metode til rensning af dendritiske filopodia-rige fraktion fra den fagocytiske Cup-lignende fremspringende struktur på dyrkede hippocampus neuroner ved at drage fordel af den specifikke og stærke affinitet mellem en dendritisk filopodial adhæsions molekyle, TLCN og et ekstracellulær matrix molekyle, vitronectin.