Apresentamos um protocolo usando imagens de tomografia microcomputísica de alta resolução para determinar se o voo espacial induziu danos em estruturas oculares. O protocolo mostra a medição micro-CT-derivada de estruturas oculares ex vivo roedores. Demonstramos a capacidade de avaliar alterações morfológicas oculares após o voo espacial usando uma técnica tridimensional não destrutiva para avaliar danos oculares.