Här tillhandahålls ett protokoll för time-lapse-avbildning av okulär morfogenes med hjälp av ett kommersiellt tillgängligt ljusarkmikroskop och en arbetsstation för bildbehandling för att analysera de resulterande data. Detta protokoll beskriver procedurerna för embryoanestesi, inbäddning i låg smälttemperatur agaros, suspension i bildkammaren, inställning av bildparametrarna och slutligen analys av bilddata med hjälp av bildanalysprogramvara.