वैकल्पिक स्प्लिसिंग (एएस) और वैकल्पिक पॉलीएडेनाइलेशन (एपीए) ट्रांसक्रिप्ट आइसोफॉर्म और उनके उत्पादों की विविधता का विस्तार करते हैं। यहां, हम प्रयोगात्मक स्थितियों में अलग-अलग एएस और एपीए का पता लगाने और कल्पना करने के लिए थोक आरएनए-सेक और 3 'एंड सीक्वेंसिंग परख का विश्लेषण करने के लिए जैव सूचना विज्ञान प्रोटोकॉल का वर्णन करते हैं।