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ऊतक में प्रोटीन और आरएनए अभिव्यक्ति की स्थानिक प्रोफाइलिंग: वर्चुअल माइक्रोडिसेक्शन को ठीक करने के लिए एक दृष्टिकोण
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Chapters
- 00:05Introduction
- 00:44Automated Visualization Protocol for Spatial Proteomics Assays
- 06:02Spatial Profiling Platform Protocol for Proteomics Assay
- 06:47ROI Selection for Spatial Transcriptomics Assays
- 07:10Results: Application of the Automated TSA Based Visualization Protocol in Combination with Spatial Proteomics Assays and Detection of Small ROIs in the Spatial Transcriptomics Protocol
- 08:47Conclusion
यहां, हम ट्यूमर माइक्रोएन्वायरमेंट को बेहतर ढंग से चिह्नित करने और विशिष्ट सेल आबादी की पहचान करने के लिए स्थानिक ओमिक्स प्रौद्योगिकियों के लिए रुचि के क्षेत्रों (आरओआई) को ठीक करने के लिए एक प्रोटोकॉल का वर्णन करते हैं। प्रोटिओमिक्स परख के लिए, स्वचालित अनुकूलित प्रोटोकॉल आरओआई चयन का मार्गदर्शन कर सकते हैं, जबकि ट्रांसस्क्रिप्टोमिक्स परख को 50 μm जितना छोटा ROIs का उपयोग करके ठीक किया जा सकता है।
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Spatial ProfilingProtein ExpressionRNA ExpressionVirtual MicrodissectionProteomicsTranscriptomicsAutomated ProtocolRegion Of Interest (ROI) SelectionFluorescent Visualization AntibodiesAutostainerDeparaffinizationCell ConditioningAntibody IncubationHRP BlockerMultimer HRP ReagentAntibody Denaturation
