तीन-फोटॉन माइक्रोस्कोपी उच्च-विपरीत प्रतिदीप्ति इमेजिंग को जीवित जैविक ऊतकों में गहराई से सक्षम बनाता है, जैसे कि माउस और ज़ेब्राफ़िश दिमाग, उच्च स्पैटिओटेम्पोरल रिज़ॉल्यूशन के साथ।