מדידת Caenorhabditis elegans חיים טווח על מדיה מוצק
Summary
במאמר זה אנו מציגים את פרוטוקול כללי למדידת אורך החיים של נמטודות שמרו על התקשורת עם מזון מוצק-UV הרג חיידקים.
Abstract
הזדקנות היא תהליך ניוונית המאופיינת הידרדרות מתקדמת של רכיבים סלולריים האברונים וכתוצאה מכך התמותה. נמטודות<em> Caenorhabditis elegans</em> התפתחה כמודל העיקריים המשמשים כדי לחקור את הביולוגיה של ההזדקנות. כי כמעט כל המשנה הביולוגי עובר ירידה תפקודית עם העלייה בגיל, תוחלת החיים היא נקודת הסיום הראשונית של עניין כאשר בהתחשב בשיעור כולל של הזדקנות. ב נמטודות, תוחלת חיים מוגדרת בדרך כלל כמספר ימים חיה נותר תגובה לגירויים חיצוניים. נמטודות יכול להיות מופצות גם בתקשורת נוזל או מוצק מדיה צלחות, טכניקות פותחו למדידת תוחלת החיים בתנאים שניהם. כאן אנו מציגים פרוטוקול כללית למדידת אורך החיים של נמטודות שמרו על התקשורת צמיחה מוצקה נמטודות והאכילה דיאטה של UV-הרג חיידקים. נהלים אלה יכולים בקלות להיות מותאם תוחלת החיים assay בתנאים משותף שונים, כולל תזונה המורכבת של חיידקים חיים, הגבלה תזונתיים, ואת התערבות RNA.
Protocol
Discussion
הבקרה הגנטית של אריכות ימים, נחקרה בהרחבה ב C. elegans, בעיקר בשל הקלות ואת המהירות שבה תוחלת החיים ניתן לקבוע. פרוטוקול שנדונו במאמר זה מתאר המסגרת הבסיסית להשגת לשחזור נתונים תוחלת החיים ב C. elegans והוא יכול לחול גם על מינים relatednematode. 2 על ידי ביצוע כמה שינוי?…
Acknowledgements
עבודה זו נתמכה על ידי פריצות דרך גלן / מרחוק פרס גרונטולוגיה ו-NIH גרנט 1R01AG031108-01 ל MKGS נתמך על ידי NIH הכשרה מענק P30AG013280. ח"כ הוא רפואי אליסון קרן מלומד חדש הזדקנות.
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Agar | Reagent | Fisher Scientific (BD Diagnostic Systems) | DF0145-17-0 (214530) | |
| Ampicillin | Reagent | MidSci | 0339 | |
| BactoTryptone | Reagent | Fisher Scientific (BD Diagnostic Systems) | DF0123-17-3 (211705) | |
| BactoPeptone | Reagent | Fisher Scientific (BD Diagnostic Systems) | DF0118-17-0 (211677) | |
| CaCl2 | Reagent | Fisher Scientific (JT Baker) | NC9699248 (1332-01) | |
| Carbenicillin | Reagent | Gold BioTechnology (GBT) | C0109 | |
| Cholesterol | Reagent | Sigma-Aldrich | C75209 | |
| Fluorodeoxyuridine (FUDR) | Reagent | Sigma-Aldrich | F0503 | |
| Isopropyl β-d-Thiogalactopyranoside (IPTG) | Reagent | Gold BioTechnology (GBT) | I2481C5 | |
| KPi Dibasic | Reagent | Fisher Scientific (JT Baker) | 5087862 (3252-01) | |
| KPi Monobasic | Reagent | Fisher Scientific (JT Baker) | 5087861 (3246-01) | |
| MgSO4 | Reagent | Fisher Scientific (JT Baker) | NC9561800 (2500-01) | |
| NaCl | Reagent | Fisher Scientific | S251 | |
| Tris | Reagent | Sigma-Aldrich | T1503 | |
| Yeast Extract | Reagent | Fisher Scientific (BD Diagnostic Systems) | DF0886-17-0 (288620) |
References
- Wood, W. B., Wood, W. B. . The Nematode Caenorhabditis elegans. , 1-16 (1988).
- Sutphin, G. L., Kaeberlein, M. Dietary restriction by bacterial deprivation increases life span in wild-derived nematodes. Exp Gerontol. 43, 130-135 (2008).
- Garigan, D. Genetic analysis of tissue aging in Caenorhabditis elegans: a role for heat-shock factor and bacterial proliferation. Genetics. 161, 1101-1112 (2002).
- Chen, D., Pan, K. Z., Palter, J. E., Kapahi, P. Longevity determined by developmental arrest genes in Caenorhabditis elegans. Aging Cell. 6, 525-523 (2007).
- Curran, S. P., Ruvkun, G. Lifespan regulation by evolutionarily conserved genes essential for viability. PLoS Genet. 3, e56-e56 (2007).
- Dillin, A. Rates of behavior and aging specified by mitochondrial function during development. Science. 298, 2398-2401 (2002).
- Hamilton, B. A systematic RNAi screen for longevity genes in C. elegans. Genes Dev. 19, 1544-1555 (2005).
- Hansen, M., Hsu, A. L., Dillin, A., Kenyon, C. New genes tied to endocrine, metabolic, and dietary regulation of lifespan from a Caenorhabditis elegans genomic RNAi screen. PLoS Genet. 1, 119-128 (2005).
- Lee, S. S. A systematic RNAi screen identifies a critical role for mitochondria in C. elegans longevity. Nat Genet. 33, 40-48 (2003).
- Smith, E. D. Age- and calorie-independent life span extension from dietary restriction by bacterial deprivation in Caenorhabditis elegans. BMC Dev Biol. 8, 49-49 (2008).
- Hodgkin, J., Horvitz, H. R., Brenner, S. Nondisjunction Mutants of the Nematode CAENORHABDITIS ELEGANS. Genetics. 91, 67-94 (1979).
- Emmons, S. W., Sternberg, P. W., Riddle, D. L., Blumenthal, T., Meyer, B. J., Priess, J. R. . C. ELEGANS II. , (1997).
- Lipton, J., Kleemann, G., Ghosh, R., Lints, R., Emmons, S. W. Mate searching in Caenorhabditis elegans: a genetic model for sex drive in a simple invertebrate. J Neurosci. 24, 7427-7434 (2004).
- Davis, B. O., Anderson, G. L., Dusenbery, D. B. Total luminescence spectroscopy of fluorescence changes during aging in Caenorhabditis elegans. Biochemistry. 21, 4089-4095 (1982).
- Klass, M. R. Aging in the nematode Caenorhabditis elegans: major biological and environmental factors influencing life span. Mech Ageing Dev. 6, 413-429 (1977).
- Steinkraus, K. A. Dietary restriction suppresses proteotoxicity and enhances longevity by an hsf-1-dependent mechanism in Caenorhabditis elegans. Aging Cell. 7, 394-404 (2008).
