Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Biology

Изучение, зависящими от возраста геномной нестабильности использованием С. CEREVISIAE Хронологические Модель продолжительность жизни

Published: September 29, 2011 doi: 10.3791/3030

Summary

Здесь мы опишем набор мутации ДНК анализов, которые могут быть объединены с жизнью дрожжей хронологический промежуток модель для изучения генов / путей, которые регулируют или способствовать нестабильности генома ДНК в процессе старения.

Abstract

Исследования с использованием CEREVISIAE Saccharomyces старения модель обнаружили жизни регулирующих способов, которые частично сохраняются у высших эукариот 1-2. Простота и сила дрожжей старения модель может также изучить, в исследовании повреждения ДНК и генома обслуживания, а также их вклад в заболевания в процессе старения. Здесь мы описываем системы для изучения возрастных мутаций ДНК, в том числе базы замены, сдвига рамки мутации, валовой хромосомных перестроек, и гомологичные / homeologous рекомбинации, а также ядерной деятельности репарации ДНК путем объединения жизни дрожжей хронологический промежуток с простыми ДНК повреждения и мутации анализов. Методы, описанные здесь, должны способствовать выявлению генов / путей, которые регулируют геномной нестабильности и механизмов, лежащих в основе возрастных мутаций ДНК и рак у млекопитающих.

Protocol

Две жизни модели используются для изучения старения в С. CEREVISIAE: РЛС и CLS. Репликативной (начинающие) срок службы (РЛС) основана на наблюдении, что дрожжевые клетки матери проходят конечное число делений 3-6. Мы сосредоточимся на хронологический срок службы (CLS), модель, основанная на хронологическом выживания без деления дрожжей в культуре или по тарелкам 7-11. Дикие дрожжи типа растет в геометрической прогрессии в течение 10-12 часов в синтетических декстрозы полной (SDC) среде . Когда уровень глюкозы снижается, дрожжи переключается из ферментации дыхание, процесс, который называют diauxic смену. Клетки продолжают делиться медленно во время пост-diauxic фазы в течение примерно 48 часов перед входом G 0 ареста. Уровень метаболизма клеток остается высоким до дня 5-6 (день 0 является прививка день). Жизнеспособность клеток с течением времени могут быть доступны процент хронологически старения клеток, пробы каждые два дня, которые могут выйти G 0 ареста и образовывать колонии на богатых YPED пластин.

1. Дрожжи хронологический срок службы (CLS) в культуральной жидкости

  1. Привить одной колонии в 1 мл синтетического полной среде глюкозу (SDC, таблица 1) и инкубировать в течение ночи при встряхивании (220 оборотов в минуту) при температуре 30 ° C. Три inoculums от независимых колоний должны быть подготовлены для каждого штамма обеспечить биологическую реплик.
  2. Развести ночной культуры в свежую среду SDC (обычно 10 мл), OD = 0,05-0,1 (~ 1:100 разведение) и инкубировать при встряхивании (220 оборотов в минуту) при температуре 30 ° C. На этот раз точка считается день 0 хронологического старения. Поддерживать соотношении 1:5 культуры / колбы объемом (10 мл культуры в 50 мл, или на более длительный / большие эксперименты 25 мл культуры в 125 мл) для обеспечения надлежащей вентиляции.
  3. Начиная с 3-й день, удалить 2 аликвоты 10 мкл из колбы, развести 10000 раз в автоклаве воды, 10 мкл разведенного культуры (т. е. 10 4 -10) на YEPD (1% дрожжевой экстракт, 2% Бакто пептон, 2% раствором декстрозы , 2% агара), плиты, и инкубировать при 30 ° С в течение 48-72 часов до колониеобразующих объединиться (CFU) учитывается.
  4. День 3 КОЕ считается 100% выживаемости. Разведение факторов старения культуры в последующие дни должны быть соответствующим образом скорректированы для обеспечения ~ 20-100 колоний в анализе КОЕ (например, 10 4 -10, 10 4 -30, 10 3 -10 и др.). Для дикого типа в клетки DBY746 фон, CLS достигает 1% выживаемости около 11-й день.

Вариации на месте анализа жизнеспособности включают в себя:

  • Ограничение калорий (CR) глюкозой ограничений. Разбавление ночной культуры в среде глюкозы ограниченной SC (например, 0,5 или 0,05% вместо стандартных 2% глюкозы) в целом приводит к снижению плотности населения насыщения на 3 день, но значительно расширена средняя и максимальная (10% выживаемости) срок службы 12.
  • Для экстремальных CR / голода, мыть день 3 стационарных культуры фазы (как правило, 10 мл, как в шаге 3 выше) с автоклавного воды (ресуспендирования клеток равным объемом воды и спин вниз на 2500 оборотов в минуту в течение 5 минут, повторите 3 раза). Incubationof клетки в воде имитирует голода условии, что дрожжи могут столкнуться в дикой природе. Каждые два дня впоследствии, старение культуры должны быть промыты водой автоклавного и ресуспендировали в равном объеме воды, чтобы удалить какой-либо питательных веществ, освобождается от отмерших клеток лизируется. Выполнить анализ жизнеспособности путем отбора проб старения культуры, как описано выше. Это условие будет голод привели к почти удвоению среднего CLS с диким типом DBY746 штамма 12.

2. На месте анализа жизнеспособности

В жидкой культуре, малая доля выживших клеток могут вновь вошел в клеточный цикл и расти используя оставшиеся питательные вещества, или те, освобождается от отмерших клеток лизируется в среде, называется фенотипом отрастания / задыхаясь 13. Мы разработали жизнеспособность-на-пластина системы, которая использует auxotrophy из DBY746 деформации (TRP1), чтобы обойти отрастания / задыхаясь задачи, а также позволяют тестирование эффект постоянного воздействия или лишение различных внешних питательных веществ или стимулов на дрожжах CLS 11. Это, в месте анализа жизнеспособности также имитирует модель репликативной продолжительности жизни, что клетки постоянно подвергаются обильным питательных веществ в течение всего срока анализа продолжительности жизни.

  1. Привить одной колонии в 1 мл синтетического полной среде глюкозу (SDC) и инкубировать в течение ночи при встряхивании (220 оборотов в минуту) при температуре 30 ° C. По меньшей мере три inoculums от независимых колоний должны быть подготовлены для каждого штамма обеспечить биологическую реплик.
  2. Давайте культуры вырастет до ~ 10 8 кл / мл (OD 600 = ~ 10), развести culturewith автоклавного воды до 100-200 cell/10 мкл (обычно 10 4-кратное разбавление) и 1000 cells/10 мкл (10 3 -кратного разбавления).
  3. Пластина две аликвоты 10-30 мкл разведенной культуры на одной пластине триптофан отсева SDC. ДляГ каждого штамма, подготовить набор из 8 до 20 пластин и маркированы в соответствии с плотностью покрытия (например, 10 в 4 раза разбавленным, пластины 10 мкл или 10 4 -10, 10 4 -30, 10 3 -10, 10 3 -30 и т.д.), которые обеспечивают 10-100 колоний можно пересчитать в ожидании снижения жизнеспособности в процессе старения.
  4. Инкубируйте пластина установлена ​​на уровне 30 ° С в течение всего срока анализа продолжительности жизни.
  5. В день посева и каждые 2 дня, затем удалить одну пластину и по каплям добавляют 0,5 мл Триптофан (2 мг / мл), чтобы жизнеспособные клетки расти. Инкубируйте планшет при 30 ° С в течение дополнительных 48-72 часов. Граф КОЕ на жизнеспособность в день того триптофан. КОЕ в день покрытие считается 100% выживаемости.

Вариации на месте анализа жизнеспособности включают в себя:

  • Возраст клеток на агар пластин (экстремальных условиях голода). Добавить 1 мл 2 раза YPED вместо триптофана в последующие дни, чтобы рост и КОЕ счет 14.
  • Возраст клеток на пластинах с триптофаном отсева синтетических полной среде с различными источниками углерода, например, различные концентрации глюкозы (ограничение калорий глюкозой ограничения), различные источники углерода, такие как этанол, глицерин, уксусную кислоту 14. Добавьте 1 мл глюкозы / триптофан раствор (20% глюкозы и 1mg/ml триптофан), чтобы рост и КОЕ считается.
  • Другие питательные манипуляции, такие как азот.

3. Повреждение ДНК и частоты мутаций в хронологическом старения

Canavanine сопротивления (Может г) и секвенирования can1
Спонтанная частота мутаций может быть оценена путем измерения частоты canavanine сопротивления (Может г) в хронологическом старения культур. Мутации в CAN1 (YEL063) гена, который кодирует плазма аргинина permease, оказывают клетки устойчивыми к аргинин аналог L-canavanine.Can т колонии собраны в различные моменты времени могут быть сохранены для извлечения геномной ДНК и последующего секвенирования CAN1 ген, который может обеспечить мутации спектр данных (с Мутация Surveyor, SoftGenetics).

База замен (Trp + реверсия)

Штаммы с TRP1-289 содержат мутацию янтаря (C403T) в TRP1 кодирующей последовательности. Измерение частоты TRP1-289 для Trp + возврат 15 позволяет оценить базовую ставку замены в течение дрожжей старения хронологическом порядке.

Каркасно-сдвиг мутации

Lys - штамм EH150 (Мата, lys2ΔBglII, TRP1-Δ, his3-Δ200, URA3-52, ade2-1o) гаваней lys2ΔBgl мутации II, который был построен, вставив 4 нуклеотидов создать ограничение Bgl II фермента сайта в LYS2 гена . В результате +4 сдвиг в открытой рамки считывания результатов в auxotrophy для лизина, которые могут быть отменены небольшие вставки / удаления мутации 16-17.

Валовой хромосомных перестроек (ГКЛ)

Для определения валового хромосомных перестроек (ГКЛ), мы получили мутантный штамм, в котором HXT13 (YEL069), кодирование высоко избыточные гексоз транспортер, была нарушена URA3 кассеты 18. HXT13 находится 7,5 кб теломерных к CAN1 на хромосоме В. Мутации в обоих CAN1 и URA3 генов клетки оказывают сопротивление L-canavanine и 5-fluoroorotic кислоты (5FOA), соответственно. Учитывая низкую частоту точечные мутации, которые происходят в обоих генов, анализ Может 5FOA т т частоты обеспечивает оценку ГКЛ, что приведет к потере обоих генов.

Гомологичные и homeologous рекомбинации

Для контроля уровня гомологичных (100%) и homeologous рекомбинации (91%) в течение хронологического старения, мы получили мутанты, в которых линеаризованной плазмиды (HIS3:: интрон-ИК-URA3), несущих 100% гомологичными инвертированные повторы (IRS) (pSR406 ) или 91% homeologous IRS (pSR407) на HIS3 локус 19. Рекомбинация между НП позволяет выразить функциональный белок His3.

  1. Параллельно с нормальным анализа жизнеспособности (как описано выше), удалить соответствующее количество клеток от старения культуры,
    1. для мутации Может г, начинаются с ~ 2х10 7 клеток (200 мкл 3-й день культуры);
    2. для возврата Trp +, начните с ~ 10 8 клеток (500-1000 мкл 3-й день культуры);
    3. для Lys + сдвига рамки мутации, начните с ~ 10 8 клеток (500-1000 мкл 3-й день культуры);
    4. для ГКЛ, начните с 2-3х10 8 клеток (2-3 мл 3-й день культуры);
    5. для гомологичной рекомбинации и homeologous, начните с & тильда; 5х10 7 клеток (200-500 мкл 3-й день культуры);
    настроить покрытие суммы по снижению общего жизнеспособность и увеличение частоты мутаций в хронологическом старения (табл. 2). В случае штаммов с hypermutator фенотип (например, с недостатками в репарации ДНК), уменьшить количество выборки соответственно.
  2. Гранул клеток с настольная машина центрифуга (6000 оборотов в минуту в течение 5 мин).
  3. Ресуспендируют клеток в 1 мл автоклавного воды и гранул клетки снова.
  4. Ресуспендируют осадок клеток в 100 мкл воды. Пластина клетки,
    1. Может для т мутации, на аргинин-отсева синтетических полный пластин среды (SDC-Arg, дополненной 60 мкг / мл L-canavanine сульфата);
    2. для возврата Trp +, на триптофан-отсева пластин (SDC-Trp);
    3. для Lys + сдвига рамки мутация, по лизин-отсева пластин (SDC-Lys);
    4. для ГКЛ, на аргинин-отсева пластин (SDC-Arg) с добавлением 5FOA (1 мг / мл) и L-canavanine сульфата (60 мкг / мл);
    5. для гомологичной рекомбинации и homeologous, на гистидин-отсева пластин дополнен галактозы (2%).
  5. Граф CFUs после инкубации 3-4 дней при температуре 30 ° C. Частота мутаций нормирована на количество жизнеспособных клеток.

В дополнение к на месте анализа жизнеспособности, возраст-зависимых Trp + реверсии, Lys + сдвига рамки мутации, рекомбинации, или Может г может быть исследована в клетках, в возрасте от пластины.

  1. Пластина клеток (~ 10 8 клеток / пластину) на Trp-, Lys-Его-отсева, или L-canavanine синтетических полный пластин среды (как описано выше).
  2. Каждые два дня (или в момент достопримечательность), оценка вновь возникающих колоний.
  3. Мутация частота оценивается нормализации вновь возникающих колонии общего числа жизнеспособных клеток определенный день.

4. Translesion синтеза (TLS)

Возраст-зависимых частоты мутаций может привести к увеличению увеличился макромолекулы повреждений, уменьшилось сотовой защиты / восстановления и увеличения ошибочной репарации ДНК (например, Polζ-зависимый синтез translesion, TLS) в процессе старения. Например, долгоживущие sch9 Δ мутантов выставку повышенную экспрессию SOD2, а также снижение экспрессии ошибок репарации ДНК фермент rev1 20. Здесь мы опишем анализ сочетания повреждений ДНК-матрицы и весь ядерный экстракт оценить TLS в пробирке.

  1. Подготовка ядерный экстракт, как описано Ван и др. 21;. Количественно концентрации белка по BCA анализа (Pierce).
  2. Добавить 0, 5, 10 или 20 мкг ядерных экстрактов до 50 мкл (конечный объем) реакции содержащие TLS буфера (20 мМ HEPES, 7 мМ MgCl 2, 1 мМ DTT, 25 мМ NaCl, рН 7,8), 200 μMdNTPs и 100 нм 5'-32 P-меченых 12-Мер праймера (5'-CGA TGG TAC GGA-3 ') отожженного до 48-Мер шаблон, содержащий повреждение ДНК, представляющие интерес (5'-TCG ATA КТГ GTA CTA ATG ATT AAC GAC ТХА AGC ACG TCC GTA ОСО TCG-3 », в которой X является поврежденный участок, например, abasic сайт, 8-оксо-G и т.д.).
  3. Выдержите смесь при температуре 30 ° С в течение 30 мин, прекратить реакции с добавлением 2,5 мкл ЭДТА (20 мм) и 2 мкл протеиназы К (10 мг / мл).
  4. Purify ДНК с фенолом добычи и осаждением этанолом.
  5. Ресуспендируют ДНК в 50 мкл буфера загрузки гель (98% формамида, 20 мМ ЭДТА, и краситель).
  6. Решение translesion продуктов синтеза на 19% гель полиакриламида.
  7. Количественная TLS использованием phosphorimaging (рис. 1).

5. Представитель Результаты

Мы обычно используется КОЕ рассчитывает на 3-й день, как на 100 процентов выживания в стандартных анализа жидкостей CLS. Процент выживания в последующие дни могут быть установлены для расчета среднего (50% выживаемости) и максимальный (10% выживаемости) продолжительность жизни 12. Продолжительность жизни результаты, полученные на месте анализа жизнеспособности в целом согласуются с тех, кто использует жидкий анализа CLS, но с уменьшенной средней продолжительности жизни, что связано отчасти с тем, что клетки постоянно подвергаются питательные вещества. Наличие глюкозы ингибирует активность клеточных защиты, как показал на снижение трансактивацию стрессовую реакцию транскрипционных факторов, таких как Msn2 / 4 и Gis1 12.

Зависящими от возраста частота мутаций сильно варьируется в зависимости от штамма фон, генетические манипуляции, условия культивирования и возраста. В таблице 2 приведены типичные результаты, полученные в штамма дикого типа (DBY746).

Компонент г / л
D-глюкозы 20
Сульфат аммония 5
Азот базы (-AS/-AA) 1,8
NaH2PO4 1,4
мг / л
Аденин 80
L-аргинин 40
L-Аспарагиновая кислота 100
L-глутаминовая кислота 100
L-Гистидин 80
L-изолейцин 60
L-лейцин 120
L-лизин 60
L-метионина 80
L-фенилаланин 60
L-серин 400
L-Треонин 200
L-триптофан 80
L-тирозин 40
L-валин 150
Урацил 80

Таблица 1. Синтетический полной среде глюкозы, SDC (приспособиться к рН 6,0 с NaOH). 4-кратное превышение гистидин, лейцин, триптофан и урацил включены, чтобы компенсировать auxotrophy из DBY746 напряжения.

День 3 (среднее ± SEM) До (при старении)
Может т 1,76 ± 0,12 x10 -6 6-8 х10 -6
Trp + возврат 6,60 ± 1,70 х10 -8 1,60 х10 -6
Lys + сдвига рамки мутации 3,00 ± 0,78 х10 -8 0,70 х10 -6
ГКЛ 0,62 ± 0,10 х10 -8 0,30 х10 -6
Гомологичной рекомбинации 5,55 ± 2,74 x10 -6 27,00 х10 -6
Homeologous рекомбинации 0,12 ± 0,04 x10 -6 0,48 х10 -6

Таблица 2. Типичные частоты мутаций клетки дикого типа (DBY746) в течение хронологического старения.

Рисунок 1
Рисунок 1. Результаты translesion синтеза (TLS) 20. Ядерные экстракты из 3 дневных стационарной фазы дикого типа (DBY746) и sch9 Δ мутантных клеток инкубировали с неповрежденными или abasic сайт-шаблоны, содержащие ДНК в течение 30 мин при 30 ° С. TLS продуктов обозначены твердые (с неповрежденными шаблон) или пунктирными (с поврежденной шаблон) линий. Существовал не translesion синтез наблюдается в ядерных выписка из sch9 мутантов Δ. Бесплатный грунтовки обозначены открытые стрелки.

Discussion

Жидкие старения культур нибудь выставку отрастания / задыхаясь фенотипа 13, что затрудняет анализ CLS. Восстановление обычно происходит, когда более чем 90-99% населения утратила жизнеспособность. Этот фенотип часто ассоциируется с повышенным окислительным стрессом и / или уменьшить защиты в клетке. Например, частота этого фенотипа более чем вдвое в клетках не хватает цитозольного супероксиддисмутазы и значительно снижает в долгоживущих мутантов (например, sch9 Δ или RAS2 Δ) или мутанты гиперэкспрессией супероксид дисмутазы 22. На практике мы определяем отрастания как увеличение рентабельности или стабилизации в жизнеспособность в течение 3 последовательных выборок в фазе высокого смертности в хронологическом старения.

Возраст-зависимые частот различных мутаций ДНК сильно варьироваться в зависимости от штамма фон, генетические манипуляции, условия культивирования, а также возобновление роста / задыхаясь и крайне низкой выживаемости. Предварительно эксперименты должны проводиться во время такие пункты, как среднее и максимальное выживание с различной плотностью покрытия для мутации анализы, чтобы определить диапазон частоты мутаций, прежде чем performingthe полный анализ жизни масштабе. Дикого типа всегда должны быть включены в продолжительности жизни или учебы частоты мутаций параллельно какое-либо лечение или генетических мутантов, например, что между эксперимента-вариации могут быть учтены. Множественные биологические реплики должны быть включены в исследование, и, как жидких, так и на местах жизнеспособность / мутация анализы должны проводиться для подтверждения результатов.

Вместо того чтобы сосредоточиться на одном конкретном типе мутации ДНК, профилирование возрастной нестабильности генома с помощью нескольких тестов в комбинации, может пролить свет на конкретные повреждения ДНК и повреждение ДНК ремонт системы (систем), которые способствуют возрастные геномной нестабильности. Например, значительное увеличение валового хромосомных перестроек (ГКЛ), по сравнению с теми других мутаций ДНК, наблюдается в дикие дрожжи типа предлагая elevationof двойным разрывом нити и / или обесценения в негомологичными конце соединения (NHEJ) во время дрожжи хронологического старения (табл. 2). Can1 спектр мутаций (секвенирование гена CAN1), полученные в дикого типа старения дрожжей предложил увеличение окислительного повреждения во время хронологическое старение и ошибок репарации ДНК, тогда как в долгоживущих мутантов sch9 Δ, менее окислительных повреждений ДНК и значительно уменьшается ошибок translesion синтеза наблюдались 20.

Методы, описанные здесь могут быть дополнительно расходуется для изучения возрастных геномной нестабильности. Например, покоя и не покоящихся клеток может быть выделен из дрожжей стационарной фазы культур методом градиента плотности описывается Алленом и соавт. 23. В сочетании с мутацией анализы, описанные здесь, мы уже сообщали, что большая часть возрастных мутаций возникает из покоя клетки, а не делиться, повреждены или апоптоза клеток 20,24.

Disclosures

Нет конфликта интересов объявлены.

Acknowledgments

Мы благодарим С. Робертсон Джинкс и Е. Heidenreich за предоставление плазмид и штаммов дрожжей, П. Фама и М. Ф. Гудман за помощью анализа withthe TLS. Эта работа была поддержана, в частности, от Американской федерации по проблемам старения Исследовательский грант и AG20642 NIH, AG025135.

References

  1. Longo, V. D., Finch, C. E. Evolutionary medicine: from dwarf model systems to healthy centenarians. Science. 299, 1342-1346 (2003).
  2. Fontana, L., Partridge, L., Longo, V. D. Extending healthy life span--from yeast to humans. Science. 328, 321-326 (2010).
  3. Mortimer, R. K., Johnston, J. R. Life span of individual yeast cells. Nature. 183, 1751-1752 (1959).
  4. Muller, I., Zimmermann, M., Becker, D., Flomer, M. Calendar life span versus budding life span of Saccharomyces cerevisiae. Mech. Ageing Dev. 12, 47-52 (1980).
  5. Jazwinski, S. M., Egilmez, N. K., Chen, J. B. Replication control and cellular life span. Exp. Gerontol. 24, 423-436 (1989).
  6. Pohley, H. J. A formal mortality analysis for populations of unicellular organisms (Saccharomyces cerevisiae. Mech Ageing Dev. 38, 231-243 (1987).
  7. Longo, V. D., Gralla, E. B., Valentine, J. S. Superoxide dismutase activity is essential for stationary phase survival in Saccharomyces cerevisiae. Mitochondrial production of toxic oxygen species in vivo. J Biol Chem. 271, 12275-12280 (1996).
  8. Longo, V. The chronological life span of Saccharomyces cerevisiae. Studies of superoxide dismutase, Ras and Bcl-2 [dissertation]. , University of California Los Angeles. California Los Angeles. (1997).
  9. Fabrizio, P., Pozza, F., Pletcher, S. D., Gendron, C. M., Longo, V. D. Regulation of longevity and stress resistance by Sch9 in yeast. Science. 292, 288-290 (2001).
  10. Fabrizio, P., Longo, V. D. The chronological life span of Saccharomyces cerevisiae. Aging Cell. 2, 73-81 (2003).
  11. Madia, F., Gattazzo, C., Fabrizio, P., Longo, V. D. A simple model system for age-dependent DNA damage and cancer. Mech Ageing Dev. 128, 45-49 (2007).
  12. Wei, M. Life span extension by calorie restriction depends on Rim15 and transcription factors downstream of Ras/PKA, Tor, and Sch9. PLoS Genet. 4, e13-e13 (2008).
  13. Fabrizio, P. Superoxide is a mediator of an altruistic aging program in Saccharomyces cerevisiae. J Cell Biol. 166, 1055-1067 (2004).
  14. Wei, M. Tor1/Sch9-regulated carbon source substitution is as effective as calorie restriction in life span extension. PLoS Genet. 5, e1000467-e1000467 (2009).
  15. Capizzi, R. L., Jameson, J. W. A table for the estimation of the spontaneous mutation rate of cells in culture. Mutat Res. 17, 147-148 (1973).
  16. Heidenreich, E., Novotny, R., Kneidinger, B., Holzmann, V., Wintersberger, U. Non-homologous end joining as an important mutagenic process in cell cycle-arrested cells. Embo J. 22, 2274-2283 (2003).
  17. Heidenreich, E., Wintersberger, U. Replication-dependent and selection-induced mutations in respiration-competent and respiration-deficient strains of Saccharomyces cerevisiae. Mol Gen Genet. 260, 395-400 (1998).
  18. Chen, C., Kolodner, R. D. Gross chromosomal rearrangements in Saccharomyces cerevisiae replication and recombination defective mutants. Nat Genet. 23, 81-85 (1999).
  19. Datta, A., Adjiri, A., New, L., Crouse, G. F., JinksRobertson, S. Mitotic crossovers between diverged sequences are regulated by mismatch repair proteins in Saccaromyces cerevisiae. Mol Cell Biol. 16, 1085-1093 (1996).
  20. Madia, F. Oncogene homologue Sch9 promotes age-dependent mutations by a superoxide and Rev1/Polzeta-dependent mechanism. J Cell Biol. 186, 509-523 (2009).
  21. Wang, Z. Controlled expression of recombinant genes and preparation of cell-free extracts in yeast. Methods Mol Biol. 313, 317-331 (2006).
  22. Fabrizio, P., Pletcher, S. D., Minois, N., Vaupel, J. W., Longo, V. D. Chronological aging-independent replicative life span regulation by Msn2/Msn4 and Sod2 in Saccharomyces cerevisiae. FEBS Lett. 557, 136-142 (2004).
  23. Allen, C. Isolation of quiescent and nonquiescent cells from yeast stationary-phase cultures. J Cell Biol. 174, 89-100 (2006).
  24. Madia, F. Longevity mutation in SCH9 prevents recombination errors and premature genomic instability in a Werner/Bloom model system. J Cell Biol. 180, 67-81 (2008).

Tags

Генетика выпуск 55, Продолжительность жизни старение частота мутаций нестабильность генома
Изучение, зависящими от возраста геномной нестабильности использованием<em> С. CEREVISIAE</em> Хронологические Модель продолжительность жизни
Play Video
PDF DOI

Cite this Article

Wei, M., Madia, F., Longo, V. D.More

Wei, M., Madia, F., Longo, V. D. Studying Age-dependent Genomic Instability using the S. cerevisiae Chronological Lifespan Model. J. Vis. Exp. (55), e3030, doi:10.3791/3030 (2011).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter