Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Environment

En høj overførselshastighed Assay for forudsigelse af kemiske toksicitet af automatiseret fænotypiske profilering af Caenorhabditis elegans

Published: March 14, 2019 doi: 10.3791/59082
* These authors contributed equally

Summary

En kvantitativ metode er blevet udviklet for at identificere og forudse kemikalier akutte toksicitet af automatisk analysere fænotypiske profilering af Caenorhabditis elegans. Denne protokol beskriver, hvordan du behandler orme med kemikalier i en 384-godt plade, fange videoer og kvantificere toksikologiske relaterede fænotyper.

Abstract

Anvendelse af toksicitetstest af kemikalier i højere orden organismer, såsom mus eller rotter, er tidskrævende og dyrt, på grund af deres lange levetid og vedligeholdelse problemer. Tværtimod nematode Caenorhabditis elegans (C. elegans) har fordele ved at gøre det et ideelt valg for afprøvning af toksicitet: en kort levetid, nem dyrkning og effektiv reproduktion. Her, beskriver vi en protokol for den automatiske fænotypiske profilering af C. elegans i en 384-godt plade. Ødelægge orme er kulturperler i en 384-godt plade med flydende medium og kemisk behandling, og videoer er taget af hver brønd til at kvantificere de kemiske indflydelse på 33 orm funktioner. Eksperimentelle resultater viser, at de kvantificerede fænotype funktioner kan klassificere og forudsige den akutte toksicitet for forskellige kemiske stoffer og fastsætte en prioriteringsliste for yderligere traditionelle kemiske toksicitet bedømmelse test i en gnaver model.

Introduction

Sammen med den hurtige udvikling af kemiske forbindelser anvendes til industriel produktion og folks daglige liv, er det vigtigt at undersøge toksicitet test modeller for kemikalier. I mange tilfælde, er de gnaver dyremodel ansat til at evaluere den potentielle toksicitet af forskellige kemikalier på sundhed. Bestemmelse af dødbringende koncentrationer (dvs. den analyserede 50% dødelig dosis [LD50] forskellige kemikalier) bruges generelt, som de traditionelle parameter i en gnaver (rotte/mus) model in vivo, som er tidskrævende og meget dyrt. Hertil kommer, på grund af Reducer, forfine, eller erstatte (3R) princippet, der er centrale for dyrevelfærd og etik, nye metoder, som giver mulighed for udskiftning af højere dyr er værdifulde for videnskabelig forskning1,2,3 . C. elegans er en fritlevende nematode, der har været isoleret fra jord. Det har været almindeligt anvendt som en forskning organisme i laboratoriet på grund af dets gavnlige egenskaber, såsom en kort levetid, nem dyrkning og effektiv reproduktion. Derudover er mange grundlæggende biologiske veje, herunder grundlæggende fysiologiske processer og stress reaktioner i C. elegans, bevaret i større pattedyr4,5,6,7 , 8. i et par af sammenligninger vi og andre har gjort, er der en god overensstemmelse mellem C. elegans toksicitet og toksicitet observeret i gnavere9. Alt dette gør C. elegans en god model til at teste effekten af kemiske toksicitet in vivo.

For nylig, nogle undersøgelser kvantificeres de fænotypiske egenskaber i C. elegans. Funktionerne kan bruges til at analysere toksicitet af kemikalier2,3,10 og ældning af orme11. Vi har også udviklet en metode, der kombinerer en flydende orm dyrkning system og et billede analysesystem, hvor ormene er kulturperler i en 384-godt plade under forskellige kemiske behandlinger12. Denne kvantitative teknik er udviklet til at automatisk analysere de 33 parametre af C. elegans efter 12-24h af kemisk behandling i en 384-godt plade med flydende medium. En automatiseret mikroskop fase bruges til eksperimenterende video erhvervelse. Videoerne er behandlet af en custom-designet program, og 33 funktioner med relation til orme bevægelige adfærd er kvantificeret. Metoden bruges til at kvantificere orm fænotyper under behandlingen af 10 forbindelser. Resultaterne viser, at forskellige toksicitet kan ændre fænotyper af C. elegans. Disse kvantificerede fænotyper kan bruges til at identificere og forudsige forskellige kemiske stoffer akutte toksicitet. Det overordnede mål med denne metode er at lette observation og fænotypiske kvantificering af eksperimenter med C. elegans i en flydende kultur. Denne metode er nyttig til anvendelse af C. elegans i kemiske toksicitet evalueringer og fænotype kvantificeringer, der hjælpe med at forudsige den akutte toksicitet af forskellige kemiske stoffer og fastsætte en prioriteringsliste for yderligere traditionelle kemiske toksicitet bedømmelse test i en gnaver model. Derudover kan denne metode anvendes til toksicitet screening og testning af nye kemikalier eller sammensat som food additive agent forurening, pharmacautical forbindelser, miljømæssige eksogene sammensatte og så videre.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

Protokollen følger retningslinjerne dyrs pleje af dyr etiske komité i Beijing Center for sygdomsforebyggelse og -kontrol i Kina.

1. kemiske forberedelse

  1. Få kemikalier (tabel 1 og Tabel af materialer).
  2. Bestemme de højeste og laveste dosering af de enkelte kemikalier til et minimum koncentration på 100% dødelighed (LC100, 24 h) og en maksimal koncentration af 100% nonlethality (LC0, 24 h) til orme. Brug mindst seks fortyndinger af den højeste koncentration (tabel 1).
    Bemærk: Foretage en foreløbig orm dødelighed test9 for at udforske LC100 og LC0 for et nyt kemikalie, for at fastlægge doseringen.
  3. Fortyndes hvert kemikalie med K-medium (Table of Materials) til 2 x den nødvendige koncentration. Anvende K-medium som kontrol for at sammenligne fænotype ændringer forårsaget af kemikalier.
    1. For eksempel, forberede 7 gradient koncentrationer af cadmium chlorid (CdCl2) (tabel 1). For at forberede 2 x den højeste koncentreret vandig opløsning (4.64 mg/mL), 92.8 mg CdCl2 solid pulver i 8 mL af K-medium opløses og fylde op til 10 mL efter pulveret er helt opløst. Forbered de andre koncentrationsniveauer ved fortynding med K-medium.
  4. Forbered otte parallelle brønde for hver koncentration i de kemiske gradient. Hver indeholder godt 50 µL af 2 x kemiske løsning. Forbered mindst tre grupper af otte parallelle wells af K-medium som kontrolelementer (tabel 2).
    Bemærk: kort sagt, et volumen på 500 µL af 2 x brugsopløsning er nødvendige for en enkelt dosis af hvert kemikalie.

2. orm forberedelse

  1. Få vildtype N2 orme og Escherichia coli OP50 stammer fra Caenorhabditis genetik Center (CGC).
  2. Få synkroniseret L4 orme.
    1. Vælge en enkelt koloni af E. coli OP50 fra streak plade. Aseptisk podes koloni i 100 mL LB bouillon og dyrke det natten over ved 37 ° C.
      Bemærk: E. coli OP50 løsning er nu klar til såning at ødelægge vækstzoner medium (NGM, Tabel af materialer).
    2. Hæld NGM i en 90 mm plast Petri plade. Frø hver plade med 300 µL af E. coli OP50 løsning dagen efter at hælde. Inkuber N2 orme på NGM pladerne med OP50 ved 20 ° C i ca 2-3 dage før de fleste af ormene er nået til det voksne Stadium.
    3. Høst fælderne orme i en 15 mL sterilt konisk centrifugeglas med steril H2O. Lad orme slå sig ned i mindst 2 min., Aspirér H2O og tilsættes 5 mL af blegemiddel buffer (Tabel af materialer).
    4. Vortex røret i 5 min, spin tube for 30 s (på 1.300 x g) at pille æggene, og supernatanten.
    5. Vask æg med 5 mL sterilt H2O og vortex røret for 5 s. centrifugeres røret i 30 s (på 1.300 x g), Fjern supernatanten og vask igen.
    6. Tilsæt æg på en ny NGM tallerken med OP50. Inkuber dem ved 20 ° C. Overvåge de skraverede L1 orme næste morgen; ormene vil nå L4 scenen i ca. 40 h.
  3. Vask ormene L4 off 90 mm Petri plader med K-medium ind i en 50 mL sterilt koniske rør. Justere koncentrationen af orme til ~ 40 dyr pr. 100 µL af K-medium under et stereomikroskop. Tilføje 50 µL (~ 20 orme) i hver brønd af 384-godt plade. Disse synkroniserede orme (L4 fase) er klar til den følgende behandling af kemikalier.

3. kemisk behandling og videooptagelse

Bemærk: I en 384-godt plade behandles orme (50 µL i hver brønd) til seks til syv doser af en individuel kemiske (tabel 1). Forbered otte parallelle wells, hver indeholdende 50 µL af 2 x kemiske løsning for hver dosis (otte wells er fyldt med den samme kemiske og den samme koncentration, tabel 2). Alle videoer er indsamlet ved hjælp af et digitalt kamera tilsluttet en inverteret mikroskop (Tabel af materialer). Kemisk behandling forsøget varer 24 h. Tilføj ikke bakteriel mad til hver brønd under 24 h kemisk behandling eksperimentet.

  1. Før du tilføjer kemikalierne, sæt 384-godt plade med synkroniserede ormene på den automatiske scene og tage videoer af hver brønd med den programmerede erhvervelse procedure (7 billeder per sekund for 2 s; det tager ~ 25 min til at scanne hver plade).
  2. Tilsæt 50 µL af 2 x kemiske stock tilberedt efter punkt 1 til hver brønd (tabel 2). Indstille tiden som 0 h-punktet.
  3. Inkuber 384-godt pladen ved 20 ° C og ryst den på 80 rpm i en inkubator shaker.
  4. Fjerne pladen fra rugemaskinen, og overføre det til en automatisk etape. Tage videoer af hver brønd af hele pladen, på 12 h og 24 h, for at kontrollere fænotyper af orme for hver specifikke kemisk behandling i K-medium. Ca. 25 min. er nødvendige for en plade skærm.

4. eksperiment videobehandling

Bemærk: Et program for eksperimentel video og billeder forarbejdning blev skrevet og pakket. Det kan frit downloades (Se Tabel af materialer). Den eksperimenterende video gemmes i form af en billedsekvens ramme, og ramme sekvens af hver video er gemt i en bestemt mappe. Programmet kan genkende orme og kvantificere fænotyper automatisk.

  1. Tilføj parametre, såsom ramme sequence register, output mappe, orm størrelsesparameter og parameteren bevægelse tærskel i den grafiske brugergrænseflade (GUI, figur 1). Klik på knappen analyser for at behandle de eksperimenterende billeder.
    1. Klik på knappen Vælg for at vælge billeder kildemappen.
    2. Tilføj den midterste resultat bibliotek i grænsefladen.
      Bemærk: De midterste resultater omfatter de segmenterede billeder. Disse midterste resultater er nyttige ved visuel observation af de behandlede billeder.
    3. Tilføje mappen endelige resultat i grænsefladen.
    4. Føj parameteren gennemsnitlige orm størrelse i den Orm størrelse lærebog i grænsefladen.
      Bemærk: Parameteren størrelse anvendes i eksperimenter er 2.000.
    5. Tilføje tærskel flyttede ratio i grænsefladen.
      Bemærk: Forholdet anvendes i eksperimenter er 0,93.
    6. Klik på knappen analyser at starte billedbehandling. Klik på knappen Nulstil for at rydde de tilføjede parametre.
      Bemærk: Der er 33 funktioner defineret og kvantificeret for orme. Alle de definerede fænotyper er sorteret efter kategori (listet i tabel 3). Disse funktioner kan kvantificeres fra eksperimentelle billeder. En kvantitativ sammenligning mellem forskellige kemikalier, som har forskellige toksiciteter, kan gøres ved at sammenligne disse funktioner.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Vi har testet fænotyper af orme udsættes for forskellige koncentrationer af mere end 10 kemikalier12. I testen, var 33 forskellige funktioner kvantificeres for hver kemisk forbindelse på tre gang point (0 h, 12 h og 24 h). Tidligere, var en sammenligning mellem en manuel og en automatisk analyse af en levetid assay gjort11,12. I denne analyse fandt vi, at kemikalier og koncentrationer kan påvirke orm fænotyper. En oversigt over denne metode er vist i figur 2.

Resultater (figur 3 og figur 4,c, d) viste, at ormene døde hurtigt som kemiske koncentrationen øges. Ved højere koncentrationer, orme blev ranke og mindre krumme end ved lavere koncentrationer eller i kontrolgruppen (figur 3 og figur 4b). I begyndelsen (på 0 h) var der ingen signifikant forskel mellem kontrol (K-medium) og kemiske behandlinger for alle fænotyper. Efter 12 h af behandling med en given kemiske dosering, fænotyper af orme viste forskellige grader af forskelle mellem kontrol og forskellige koncentration grupper. For eksempel, den største akse længde forøget som tid steg. Der er også en gradient tendens fra lavere til højere kemiske koncentrationer. Den gradient tendens af forskellige kemiske koncentrationer var også signifikant mindre akse længde (figur 4a, b).

I denne analyse beregnet den orm motilitet på to måder, baseret på området ormen flyttede og motilitet ratio (figur 4c, d). Motilitet resultaterne af begge måder viste lignende mønstre. Der var ingen signifikant forskel af ormen motilitet blandt forskellige koncentrationer og kontrolgrupper fra begyndelsen (på tidspunkt 0 h). Som tiden gik, fald orme i kontrolgruppen viste et stabilt i motilitet. På 12 h, orme, der undergik kemiske behandlinger i forskellige koncentrationer viste betydelige forskelle i motilitet sammenlignet med kontrolgruppen. Derudover orme under højere koncentration behandlinger viste svage motilitet sammenlignet med orme under lavere koncentration behandlinger. Dette indikerer at orme under højere koncentration behandlinger blev mindre motile og døde hurtigere (figur 4c, d). Disse resultater tyder på, at den designede metode er nyttig for kemiske toksicitet vurderinger, og den kvantitative fænotyper af C. elegans er nyttige markører for kemiske toksicitet identifikation.

Figure 1
Figur 1 : Grænsefladen for softwaren. Venligst klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 2
Figur 2 : Pipeline af en høj overførselshastighed assay for forudsigelse af kemiske toksicitet af automatiserede fænotypiske profilering af Caenorhabditis elegans. Venligst klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 3
Figur 3 : Eksperimenterende billeder af orme under 4.64 mg/mL CdCl2 (øverste panel), 0.464 mg/mL CdCl2 (midterste panel) og K-medium (nederste panel), på forskellige tidspunkter. Billederne viser statusændringer af orme under kemisk behandling eller i en kontrolgruppe i én repræsentant godt af 384-godt plade i hele tiden. Venligst klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 4
Figur 4 : De kvantificerede funktioner af orme under forskellige koncentrationer af CdCl2. (en) de kvantificerede største akse længde. (b) kvantificerede mindre akse længde. (c) de kvantificerede motilitet af den flyttede område. (d) de kvantificerede motilitet af den flyttede område/orm størrelse. Baren parceller viser den gennemsnitlige kvantificering for hver funktion på enkelt orme. Fejllinjer betegne ± standardafvigelse (SD). Koncentration enhed = mg/mL. Venligst klik her for at se en større version af dette tal.

Table 1
Tabel 1: eksponeringskoncentration af 10 kemikalier til 384-godt-plade C. elegans akut toksicitet test.

Table 2
Tabel 2: En skematisk af 384-godt plade layout.

Table 3
Tabel 3: Defineret fænotyper af orme.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Fordelene ved C. elegans har ført til den øgede brug i toksikologi9, både for Mekanistiske undersøgelser og høj overførselshastighed screening tilgange. En øget rolle for C. elegans i supplerer andre modelsystemer i toksikologiske forskning har været bemærkelsesværdig i de seneste år, især for den hurtige toksicitet vurdering af nye kemikalier. Denne artikel giver en ny analyse af høj overførselshastighed, kvantitativ screening af ormen fænotyper i en 384-godt plade for automatisk identifikation og vurdering af kemiske toksicitet. Denne analyse er ideelt til akut toksicitetstest af kemikalier inden for 24 timer, og det kunne anvendes til subakutte toksicitet test samt når flere tidspunkter af data er indsamlet og fødekilde (OP50) er leveret til ormene.

Det medium, der anvendes til fortynding af kemikalier kan variere; Vi vælger K-medium i analysen ved at henvise til Sofieet al. 13. orme var kulturperler i K-medium i både kontrol- og kemisk behandlingsgrupper. Et kunstigt ferskvand løsning eller en jordvæsken med lav ionisk styrke kunne være alternativer til K-medium.

Kemikalier med forskellige toksicitet kan ændre fænotyper af C. elegans i forskellige mønstre. Kemikalier, der anvendes i denne test blev valgt fra de tredje til sjette kategorier af globalt harmoniserede System for klassificering og mærkning af kemikalier (GHS). C. elegans blev udsat for kemikalier på seks eller flere dosis niveauer, som dækkede området 0-100% dødelighed dosering. For disse stoffer med lav vandopløselighed anbefales DMSO at fremme den kemisk opløsning i vand. Som en høj koncentration af DMSO kan påvirke orm udvikling og levetid14, ikke mere end 0,2% DMSO bør anvendes for akvatiske tests.

Funktionerne automatisk kvantificerede viser signifikant forskel mellem forskellige toksiciteter, som viser, at disse kvantificerede fænotyper af orme er meget nyttige i at identificere toksiciteten af kemikalier. Det angives, at fænotypiske profilering afslørede bevarede funktioner til at klassificere og forudsige toksiciteten af forskellige kemikalier med ødelægge C. elegans som en in vivo model organisme.

Den amerikanske nationale toksikologi Program (NTP) etableret Tox21 Fællesskabet gennem et aftalememorandum med den amerikanske Environmental Protection Agency (EPA) og National Institutes of Health (NIH) Chemical genomforskning Center, nu National Center for Fremrykkende translationel videnskab (NCATS). Tox21 bruger høj overførselshastighed in vitro screening og in vivo alternative dyremodel test for at identificere mekanismer af toksicitet, at prioritere kemikalier til yderligere in vivo toksicitetstest og udvikle prognosemodeller af menneskelige toksikologiske svar. Som en del af denne indsats, blev C. elegans anvendt til at screene EPA'S ToxCast fase I og fase II biblioteker, der indeholder kemikalier, 292 og 676 henholdsvis for kemikalier, der fører til nedsat larve udvikling og vækst15. COPAS (sammensat objekt parametrisk Analyzer og sorteringsanlæg) platform er også blevet brugt til orm toksikologiske screening studier2. COPAS platform kvantificerer dog kun få funktioner, som ormen bredde, orm længde og fluorescens-intensiteten. Denne metode er en forbedring af nuværende metoder bruger orme til hurtigt prescreen toksiciteten af nye kemikalier.

Der er flere kritiske trin i protokollen: orm kultur i en 384-godt plade, den kemiske behandling, den eksperimentelle billedoptagelse og fænotype kvantificering. Sammenlignet med traditionelle toksicitet evalueringsmetoder, kan denne protokol kvantificere nogle fænotyper af orme, der er vanskeligt at beregne manuelt og nyttigt at afspejle toksiciteter hvert kemikalie, som ormen motilitet, orm bredde, orm størrelse og grå intensitet. Klart, denne høj overførselshastighed assay for forudsigelse af kemiske toksicitet vil være en værdifuld toksicitet model tilgang og kunne bruges til prescreening af kemikalier før gnavere dyreforsøg.

I Resumé baner denne teknik en vej på hurtige toksicitet vurdering på flere områder. Forskere kunne anvende metoden til akut analyse af toksicitet i fødevarebårne toxicosis, sikkerhedsevaluering af lægemiddelsammensætninger, samt akut toksicitet screening og påvisning af nye kemikalier og miljømæssige eksogene forbindelser.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Forfatterne har ikke noget at oplyse.

Acknowledgments

Forfatterne takke CGC til venligst at sende C. elegans. Dette arbejde blev støttet af nationale nøglen forskning og udvikling Program af Kina (#2018YFC1603102, #2018YFC1602705); National Natural Science Foundation i Kina Grant (#31401025, #81273108, #81641184), hovedstaden sundhedsforskning og udvikling af særlige projekt i Beijing (#2011-1013-03), fondens åbningen af Beijing centrale laboratorium af miljømæssige toksikologi (# 2015HJDL03), og Natural Science Foundation i Shandong-provinsen, Kina (ZR2017BF041).

Materials

Name Company Catalog Number Comments
2-Propanol Sigma-Aldrich 59300
384-well plates Throme 142761
Agar Bacto 214010
Atropine sulfate Sigma-Aldrich PHL80892
Bleach buffer 0.5 mL of 10 M NaOH, 0.5 mL of5% NaClO, 9 mL ofultrapure water
Cadmium chloride Sigma-Aldrich 202908
Calcium chloride Sigma-Aldrich 21074
CCD camera Zeiss AxioCam HRm Zeiss microscopy GmbH
Cholesterol Sigma-Aldrich C8667
Copper(II) sulfate Sigma-Aldrich 451657
Ethanol Sigma-Aldrich 24105
Ethylene glycol Sigma-Aldrich 324558
Glycerol Sigma-Aldrich G5516
K-Medium 3.04 g of NaCl and 2.39 g of KCl in 1 L ultrapure water
LB Broth  10 g/L Tryptone, 5 g/L Yeast Extract, 5 g/L NaCl 
Magnesium sulfate heptahydrate Sigma-Aldrich 63140
NGM Plate 3 g ofNaCl, 17 g ofagar, 2.5 g ofpeptone in 1 L of ultrapure water, after autoclave add 1 mL of cholesterol (5 mg/mL in ethanol), 1 mL of MgSO4 (1 M), 1 mL of CaCl2 (1 M), 25 mL of PPB buffer
Peptone Bacto 211677
Potassium chloride Sigma-Aldrich 60130
Potassium phosphate dibasic Sigma-Aldrich 795496
Potassium phosphate monobasic Sigma-Aldrich 795488
PPB buffer 35.6 g of K2HPO4, 108.3 g of KH2PO4 in 1 L ultrapure water
shaker ZHICHENG ZWY-200D
Sodium chloride Sigma-Aldrich 71382
Sodium fluoride Sigma-Aldrich s7920
Sodium hydroxide Sigma-Aldrich 71690
Sodium hypochlorite solution Sigma-Aldrich 239305
The link of program https://github.com/weiyangc/ImageProcessForWellPlate
Tryptone Sigma-Aldrich T7293
Yeast extract Sigma-Aldrich Y1625
Zeiss automatic microscope  Zeiss AXIO Observer.Z1 Zeiss automatic microsco with peproprietary software Zen2012 and charge coupled device(CCD) camera

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Anderson, G. L., et al. Assessing behavioral toxicity with Caenorhabditis elegans. Environmental Toxicology and Chemistry. 23 (5), 1235-1240 (2004).
  2. Boyd, W. A., et al. A high-throughput method for assessing chemical toxicity using a Caenorhabditis elegans reproduction assay. Toxicology and Applied Pharmacology. 245 (2), 153-159 (2010).
  3. Boyd, W. A., Williams, P. L. Comparison of the sensitivity of three nematode species to copper and their utility in aquatic and soil toxicity tests. Environmental Toxicology and Chemistry. 22 (11), 2768-2774 (2003).
  4. Dengg, M., van Meel, J. C. Caenorhabditis elegans as model system for rapid toxicity assessment of pharmaceutical compounds. Journal of Pharmacological and Toxicological Methods. 50 (3), 209-214 (2004).
  5. Schouest, K., et al. Toxicological assessment of chemicals using Caenorhabditis elegans and optical oxygen respirometry. Environmental Toxicology and Chemistry. 28 (4), 791-799 (2009).
  6. Sprando, R. L., et al. A method to rank order water soluble compounds according to their toxicity using Caenorhabditis elegans, a Complex Object Parametric Analyzer and Sorter, and axenic liquid media. Food and Chemical Toxicology. 47 (4), 722-728 (2009).
  7. Wang, D., Xing, X. Assessment of locomotion behavioral defects induced by acute toxicity from heavy metal exposure in nematode Caenorhabditis elegans. Journal of Environmental Sciences (China). 20 (9), 1132-1137 (2008).
  8. Leung, M. C., et al. Caenorhabditis elegans: an emerging model in biomedical and environmental toxicology. Toxicological Sciences. 106 (1), 5-28 (2008).
  9. Li, Y., et al. Correlation of chemical acute toxicity between the nematode and the rodent. Toxicology Research. 2 (6), 403-412 (2013).
  10. Boyd, W. A., et al. Effects of genetic mutations and chemical exposures on Caenorhabditis elegans feeding: evaluation of a novel, high-throughput screening assay. PLoS One. 2 (12), 1259 (2007).
  11. Xian, B., et al. WormFarm: a quantitative control and measurement device toward automated Caenorhabditis elegans aging analysis. Aging Cell. 12 (3), 398-409 (2013).
  12. Gao, S., et al. Classification and prediction of toxicity of chemicals using an automated phenotypic profiling of Caenorhabditis elegans. BMC Pharmacology and Toxicology. 19 (1), 18 (2018).
  13. Moyson, S., et al. Mixture effects of copper, cadmium, and zinc on mortality and behavior of Caenorhabditis elegans. Environmental Toxicology and Chemistry. 37 (1), 145-159 (2018).
  14. Wang, X., et al. Lifespan extension in Caenorhabditis elegans by DMSO is dependent on sir-2.1 and daf-16. Biochemical and Biophysical Research Communications. 400 (4), 613-618 (2010).
  15. Boyd, W. A., et al. Developmental Effect of the ToxCast Phase I and Phase II Chemicals in Caenorhabditis elegans and Corresponding Responses in Zebrafish, Rats, and Rabbits. Environmental Health Perspectives. 124 (5), 586-593 (2016).

Tags

Miljøvidenskab sag 145 kemikalier toksicitet Caenorhabditis elegans billedanalyse fænotype kvantificering
En høj overførselshastighed Assay for forudsigelse af kemiske toksicitet af automatiseret fænotypiske profilering af <em>Caenorhabditis elegans</em>
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Gao, S., Chen, W., Zhang, N., Xu,More

Gao, S., Chen, W., Zhang, N., Xu, C., Jing, H., Zhang, W., Han, G., Flavel, M., Jois, M., Zeng, Y., Han, J. D. J., Xian, B., Li, G. A High-throughput Assay for the Prediction of Chemical Toxicity by Automated Phenotypic Profiling of Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (145), e59082, doi:10.3791/59082 (2019).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter