Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Environment

En hög genomströmning analys för Prediktion av kemiska toxiciteten av automatiserad fenotypiska profilering av Caenorhabditis elegans

Published: March 14, 2019 doi: 10.3791/59082
* These authors contributed equally

Summary

En kvantitativ metod har utvecklats för att identifiera och förutse akuta toxicitet av kemikalier genom att automatiskt analysera fenotypiska profilering av Caenorhabditis elegans. Det här protokollet beskriver hur man behandla maskar med kemikalier i en plattan med 384 brunnar, fånga videos och kvantifiera toxikologiska relaterade fenotyper.

Abstract

Tillämpa Toxicitetstestning av kemikalier i högre ordning organismer, till exempel möss eller råttor, är tidskrävande och dyrt, på grund av sin långa livslängd och underhåll problem. Tvärtom Nematoden Caenorhabditis elegans (C. elegans) har fördelar att göra det till ett idealiskt val för toxicitetstester: en kort lifespan, lätt odling och effektiv reproduktion. Här beskriver vi ett protokoll för automatisk fenotypiska profilering av C. elegans i en plattan med 384 brunnar. Nematoder maskar är odlade i en plattan med 384 brunnar med flytande medium och kemisk behandling, och videor tas av varje brunn att kvantifiera den kemiska påverkan på 33 mask funktioner. Experimentella resultat visar att de kvantifierade fenotyp funktionerna kan klassificera och förutsäga den akuta toxiciteten för olika kemiska föreningar och upprätta en prioriteringslista för ytterligare traditionella kemiska toxicitet bedömning tester i en gnagare modell.

Introduction

Tillsammans med den snabba utvecklingen av kemiska föreningar tillämpas på industriell produktion och människors dagliga liv, är det viktigt att studera de toxicitetstester modeller för kemikalier. I många fall är den gnagare djurmodell anställd för att utvärdera den potentiella toxiciteten av olika kemikalier på hälsa. Bestämningen av dödliga koncentrationer (dvs. den analyseras 50% dödliga dosen [LD50] av olika kemikalier) används i allmänhet som den traditionella parametern i en gnagare (råtta/mus) modell in vivo vilket är tidskrävande och dyrt. Dessutom, på grund av att minska, förfina eller ersätta (3R) principen som är central för djurskydd och etik, nya metoder som möjliggör utbyte av högre djur är värdefulla för vetenskaplig forskning1,2,3 . C. elegans är en frilevande nematoder som har isolerats från marken. Det har använts som en forskning organism i laboratoriet på grund av dess positiva egenskaper, som en kort lifespan, lätt odling och effektiv reproduktion. Dessutom bevaras många grundläggande biologiska spridningsvägar, inklusive grundläggande fysiologiska processer och stressreaktioner i C. elegans, i högre däggdjur4,5,6,7 , 8. i ett par jämförelser som vi och andra har gjort, det finns en god överensstämmelse mellan C. elegans toxicitet och toxicitet observerades hos gnagare9. Allt detta gör C. elegans en bra modell för att testa effekterna av kemiska toxicitet Invivo.

Nyligen har kvantifieras vissa studier de fenotypiska egenskaperna hos C. elegans. Funktionerna kan användas för att analysera toxicitet av kemikalier2,3,10 och åldrandet av maskar11. Vi har också utvecklat en metod som kombinerar en flytande mask odlingsskålar system och en bild analyssystem, där maskar är odlade i en plattan med 384 brunnar enligt olika kemiska behandlingar12. Denna kvantitativa teknik har utvecklats för att automatiskt analysera 33 parametrar i C. elegans efter 12-24h av kemisk behandling i en plattan med 384 brunnar med flytande medium. En automatiserad Mikroskop scenen används för experimentell video förvärv. Videor bearbetas av ett skräddarsydda program och 33 funktioner relaterade till maskar rörliga beteende är kvantifierade. Metoden används för att kvantifiera de masken fenotyperna under behandling av 10 föreningar. Resultaten visar att olika toxicitet kan ändra fenotyperna av C. elegans. Dessa kvantifierade fenotyper kan användas för att identifiera och förutse den akuta toxiciteten av olika kemiska föreningar. Det övergripande målet med denna metod är att underlätta observation och fenotypiska kvantifiering av experiment med C. elegans i en flytande kultur. Denna metod är användbar för tillämpningen av C. elegans i kemisk toxicitet utvärderingar och fenotyp kvantifieringar, som hjälpa till att förutsäga den akuta toxiciteten av olika kemiska föreningar och upprätta en prioriteringslista för ytterligare traditionella kemisk toxicitet bedömning på en gnagare modell. Dessutom kan denna metod tillämpas på toxicitet screening och testning av nya kemikalier eller föreningen som mat tillsatsen agent föroreningar, pharmacautical föreningar, miljömässiga exogena förening och så vidare.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

Protokollet följer riktlinjerna för djurens vård av djur etikkommittén i Beijing Center för förebyggande och kontroll i Kina.

1. kemiska beredningar

  1. Få kemikalier (tabell 1 och Tabell för material).
  2. Bestämma den högsta och lägsta dos av enskilda kemikalier för en minsta koncentration av 100% dödlighet (LC100, 24 h) och en maximal koncentration av 100% nonlethality (LC0, 24 h) till maskar. Använd minst sex spädningar av den högsta koncentrationen (tabell 1).
    Obs: Genomföra en preliminär mask dödlighet test9 för att utforska LC100 och LC0 för en ny kemisk, för att bestämma doseringen.
  3. Späd varje kemikalie med K-medium (Tabell för material) till 2 x önskad koncentration. Använd K-medium som en kontroll för att jämföra de fenotyp förändringar orsakade av kemikalier.
    1. Till exempel förbereda 7 gradient koncentrationer av kadmium klorid (CdCl2) (tabell 1). För att förbereda 2 x den högsta koncentrerad vattenlösningen (4,64 mg/mL), lös 92,8 mg CdCl2 fast pulver i 8 mL av K-medium och fyll upp till 10 mL efter pulvret är helt upplöst. Förbered de andra halter genom utspädning med K-medium.
  4. Förbered åtta parallella brunnar för varje koncentration i kemiska övertoningen. Varje innehåller väl 50 µL av 2 x kemisk lösning. Förbereda minst tre grupper av åtta parallella brunnar för K-medium som kontroller (tabell 2).
    Obs: I korthet en volym av 500 µL av 2 x fungerande lösning är nödvändigt för en enstaka dos av varje kemikalie.

2. mask förberedelse

  1. Erhålla vildtyp N2 maskar och Escherichia coli OP50 stammar från Caenorhabditis genetik Center (CGC).
  2. Få synkroniserade L4 maskar.
    1. Plocka en enda koloni av E. coli OP50 från strimma plattan. Aseptiskt Inokulera kolonin i 100 mL LB buljong och odla den över natten vid 37 ° C.
      Obs: E. coli OP50 lösningen är nu klar för sådd till nematoder tillväxtplattor medium (NGM, Tabell för material).
    2. Häll en 90 mm plast Petri plattan NGM. Utsäde varje tallrik med 300 µL av E. coli OP50 lösning dagen efter hälla. Inkubera N2 maskar på NGM plattorna med OP50 vid 20 ° C i ca 2-3 dagar tills de flesta maskarna har nått vuxen stadiet.
    3. Skörda dräktig maskar i en 15 mL steril koniskt centrifugrör med steril H2O. Låt maskarna bosätta sig i minst 2 min, aspirera H2O och tillsätt 5 mL av blekmedel buffert (Tabell för material).
    4. Vortex röret för 5 min, snurra röret för 30 s (vid 1 300 x g) till pellet äggen, och kasta bort supernatanten.
    5. Tvätta ägg med 5 mL steril H2O och vortexa röret för 5 s. Centrifugera röret i 30 s (vid 1 300 x g), ta bort supernatanten och tvätta igen.
    6. Pipettera äggen på en ny NGM tallrik med OP50. Inkubera dem vid 20 ° C. Övervaka kläckta L1 maskar nästa morgon; maskar kommer att nå L4 scenen i ungefärligt 40 h.
  3. Tvätta L4 maskar av 90 mm Petri plattorna med K-medium i ett 50 mL steril koniska rör. Justera koncentrationen av maskar att ~ 40 djur per 100 µL av K-medium under ett stereomikroskop. Tillsätt 50 µL (~ 20 maskar) i varje brunn plattan med 384 brunnar. Maskarna synkroniserade (L4 Stadium) är redo för den följande behandlingen av kemikalier.

3. kemisk behandling och video capture

Obs: I en plattan med 384 brunnar, maskar (50 µL i varje brunn) bjuds på sex till sju doser av en enskild kemikalie (tabell 1). Förbered åtta parallella brunnar, vardera innehållande 50 µL av 2 x kemisk lösning för varje dosering (åtta brunnar är fyllda med samma kemiska och samma koncentration, tabell 2). Alla videor samlas in med hjälp av en digitalkamera ansluten till ett inverterat Mikroskop (Tabell för material). Kemisk behandling experimentet varar i 24 h. Lägg inte till bakteriell mat till varje brunn under 24 h kemisk behandling experimentet.

  1. Innan du lägger kemikalierna, som 384-väl plattan med synkroniserade maskar på automatisk scenen och ta videor av varje brunn med förfarandet för programmerad förvärv (7 bilder per sekund för 2 s; det tar ~ 25 min att skanna varje platta).
  2. Tillsätt 50 µL av 2 x kemiska lager upprättad enligt avsnitt 1 för varje brunn (tabell 2). Ställ in tiden som 0 h-punkten.
  3. Inkubera plattan med 384 brunnar vid 20 ° C och skaka den vid 80 rpm i en inkubator shaker.
  4. Avlägsna plattan från inkubatorn och överföra den till en automatisk etapp. Ta videor av varje brunn av hela plattan, på 12 h och på 24 h, för att kontrollera fenotyperna av maskar för varje specifik kemisk behandling i K-medium. För en platta skärm krävs ca 25 min.

4. experiment video-bearbetning

Obs: Ett program för experimentell video och bilder bearbetning skrevs och förpackas. Det kan fritt laddas ner (se Tabell för material). Den experimentella videon lagras i form av en bildsekvens ram och stomme sekvensen av varje video lagras i en viss katalog. Programmet kan känna igen maskar och kvantifiera fenotyper automatiskt.

  1. I det grafiska användargränssnittet (GUI, figur 1), lägga till parametrar, såsom katalogen ram sekvens, utdatakatalogen, mask storlek parametern och parametern rörelse tröskel. Klicka på analysera för att bearbeta de experimentella bilderna.
    1. Klicka på Välj för att välja bilder källkatalogen.
    2. Lägg till katalogen mellersta resultatet i gränssnittet.
      Obs: Mellersta resultaten omfatta de segmenterade bilderna. Dessa mitten resultaten är användbara för visuell observation av de bearbeta bilderna.
    3. Lägg till katalogen slutresultatet i gränssnittet.
    4. Lägg till parametern genomsnittliga mask storlek i textrutan Mask storlek i gränssnittet.
      Obs: Parametern storlek används i experiment är 2 000.
    5. Lägg till tröskelvärde flyttade förhållandet i gränssnittet.
      Obs: Förhållandet används i experiment är 0,93.
    6. Klicka på analysera för att börja Bildbehandlingen. Klicka på knappen Återställ för att rensa de extra parametrarna.
      Obs: Det finns 33 funktioner definieras och kvantifieras för maskar. Alla de definiera fenotyperna är sorterade efter kategorier (anges i tabell 3). Dessa funktioner kan kvantifieras från experimentella bilder. En kvantitativ jämförelse bland olika kemikalier, som har olika toxicitet, kan göras genom att jämföra dessa funktioner.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Vi har testat fenotyperna av maskar som utsätts för olika koncentrationer av mer än 10 kemikalier12. I testet kvantifierades 33 olika funktioner för varje kemisk förening vid tre tidpunkter (0 h, 12 h och 24 h). En jämförelse mellan en handbok och en automatisk analys av en livslängd analysen gjordes tidigare,11,12. I denna analys hittade vi att kemikalier och koncentrationer kan påverka de masken fenotyperna. En översikt av denna metod visas i figur 2.

Resultaten (figur 3 och figur 4c, d) visade att maskarna dog snabbt som den kemiska koncentrationen ökade. Vid högre koncentrationer, maskar blev rakare och mindre böjd än vid lägre koncentrationer eller i kontrollgrupperna (figur 3 och figur 4b). I början (0 h) fanns det ingen signifikant skillnad mellan kontroll (K-medium) och kemiska behandlingar för alla fenotyper. Efter 12 h behandling med en viss kemisk dosering visade fenotyperna av maskar olika grader av skillnader mellan kontroll och olika koncentration grupper. Huvudaxeln längden ökade till exempel som tid ökat. Det finns också en gradient utveckling från lägre till högre kemiska koncentrationer. Gradient trenden för olika kemiska koncentrationer var också signifikant mindre axel längd (figur 4a, b).

I denna analys beräknades maskens motilitet på två sätt, baserat på området masken flyttade och motilitet i förhållande (figur 4c, d). Motilitet båda hållen visade liknande mönster. Det fanns inga signifikanta skillnader av den masken motiliteten bland olika koncentrationer och kontrollgrupper i början (vid 0 h tidpunkten). Eftersom tiden gick, minskning maskar i kontrollgrupperna visade en stabil motilitet. Vid 12 h, maskar som genomgick kemiska behandlingar vid olika koncentrationer visade signifikanta skillnader i motilitet jämfört med kontrollgrupperna. Dessutom maskar under högre koncentration behandlingar visade svaga motilitet jämfört med maskar under lägre koncentration behandlingar. Detta indikerar att maskar under högre koncentration behandlingar blev mindre rörliga och dog snabbare (figur 4c, d). Dessa resultat tyder på att utformade metoden är användbar för kemisk toxicitet bedömningar, och de kvantifierade fenotyperna av C. elegans är användbara markörer för kemisk toxicitet identifiering.

Figure 1
Figur 1 : Gränssnittet för programvaran. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 2
Figur 2 : Försäljningsförloppet för en hög genomströmning analys för förutsägelse av kemiska toxicitet genom automatiserade fenotypiska profilering av Caenorhabditis elegans. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 3
Figur 3 : Experimentell bilder av maskar under 4,64 mg/mL CdCl2 (övre panel), 0.464 mg/mL CdCl2 (mellersta panelen) och K-medium (nedre panelen), vid olika tidpunkter. Bilderna visar status ändras av maskar under kemisk behandling eller i en kontrollgrupp i en representativ väl av 384-väl plattan hela tiden. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 4
Figur 4 : De kvantifierade funktionerna av maskar under olika koncentrationer av CdCl2. (en) kvantifierad huvudaxeln längd. (b) kvantifierad lillaxeln längd. (c) de kvantifierade motiliteten genom de flyttade område. (d) de kvantifierade motiliteten genom de flyttade område/mask storlek. I baren tomter Visa genomsnittliga kvantifiering för varje funktion på enstaka maskar. Felstaplar beteckna ± standardavvikelse (SD). Enheten koncentration = mg/mL. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

Table 1
Tabell 1: exponeringskoncentrationen 10 kemikalier för 384-brunn-plattan C. elegans akut toxicitet test.

Table 2
Tabell 2: En schematisk av plattan med 384 brunnar layout.

Table 3
Tabell 3: Definierade fenotyper av maskar.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Fördelarna med C. elegans har lett till dess ökande användning i toxikologi9, både för mekanistiska studier och high-throughput screening metoder. En ökad roll för C. elegans i kompletterar andra modellsystem i toxikologisk forskning har varit anmärkningsvärd under de senaste åren, särskilt för snabb toxicitet bedömning av nya kemikalier. Denna artikel ger en ny analys av hög genomströmning, kvantitativ genomgång av masken fenotyper i en plattan med 384 brunnar för automatisk identifiering och bedömning av kemisk toxicitet. Denna analys är idealisk för akut toxicitet provning av kemikalier inom 24 h, och det skulle kunna tillämpas på subakut toxicitet samt när mer tid datapunkterna samlas och mat källa (OP50) levereras för maskar.

Det medium som används för att späda ut kemikalier kan variera; Vi valde K-medium i analysen genom att hänvisa till Sofieo.a. 13. maskar var odlade i K-medium i både kontroll och kemiska behandlingsgrupperna. En konstgjord sötvatten eller lösningen en jord med låg jonstyrka kan vara alternativ till K-medium.

Kemikalier med olika toxicitet kan förändra fenotyperna av C. elegans i olika mönster. Kemikalier som används i detta test valdes från tredje till sjätte kategorier globalt harmoniserade systemet för klassificering och märkning av kemikalier (GHS). C. elegans exponerades för kemikalier på sex eller fler doser, som täckte den 0-100% dödlighet doseringsintervall. För dessa kemikalier med låg vattenlöslighet rekommenderas DMSO att främja den kemisk upplösningen i vatten. En hög koncentration av DMSO kan påverka masken utveckling och livslängd14, högst 0,2% DMSO bör användas för vattenlevande tester.

Funktionerna automatiskt kvantifierade visar signifikant skillnad bland annat toxicitet, vilket visar att dessa kvantifierade fenotyper av maskar är mycket användbara i att identifiera toxicitet av kemikalier. Det anges att fenotypiska profilering avslöjade bevarade funktioner att klassificera och förutsäga toxiciteten av olika kemikalier med nematoder C. elegans som en Invivo modellorganism.

US National Toxicology Program (NTP) etablerade Tox21 gemenskapen genom ett samförståndsavtal med den amerikanska Environmental Protection Agency (EPA) och National Institutes of Health (NIH) kemiska genomik Center, nu National Center for Framryckande translationell Sciences (NCATS). Tox21 använder hög genomströmning in vitro-screening och Invivo alternativa djurmodell tester för att identifiera mekanismer för toxicitet, att prioritera kemikalier för ytterligare i vivo toxicitet och att utveckla prediktiva modeller av mänsklig toxikologiska Svaren. Som en del av denna insats användes C. elegans att skärmen EPA: s ToxCast fas I och Fasii bibliotek, som innehåller kemikalier 292 och 676, respektive, för kemikalier som leder till minskade larval utveckling och tillväxt15. COPAS (komplexa objekt parametriska Analyzer och sorterare) plattformen har också använts för mask toxikologisk screening studier2. Dock kvantifierar COPAS plattformen endast några funktioner, såsom masken bredd, mask längd och fluorescensintensiteten. Denna metod är en förbättring av nuvarande metoder med hjälp av maskar att snabbt prescreen toxiciteten av nya kemikalier.

Det finns flera kritiska steg inom protokollet: mask kulturen i en plattan med 384 brunnar, kemisk behandling, experimentell stillbilder och fenotyp kvantifiering. Jämfört med traditionella toxicitet utvärderingsmetoder, kan detta protokoll kvantifiera vissa fenotyper av maskar som är svåra att beräkna manuellt och användbar att återspegla toxiciteten av varje kemikalie, som masken motilitet, masken bredd, mask storlek och grå intensitet. Klart, denna hög genomströmning analys för förutsägelse av kemiska toxicitet kommer att vara en värdefull toxicitet modellstrategi och skulle kunna användas för den prescreening av kemikalier innan gnagare djurförsök.

Sammanfattningsvis banar denna teknik en väg på snabba toxicitet bedömning i flera områden. Forskarna kunde använda metoden akut analys av toxicitet i livsmedelsburna toxicosis, säkerhetsutvärderingen av läkemedelssubstanser, samt den akut toxicitet screening och upptäckt av nya kemikalier och miljö exogena föreningar.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Författarna har något att avslöja.

Acknowledgments

Författarna vill tacka CGC för Vänligen skicka den C. elegans. Detta arbete stöddes av nationella nyckel forskning och utveckling Program i Kina (nr 2018YFC1603102, nr 2018YFC1602705); National Natural Science Foundation Kina Grant (nr 31401025, #81273108 #81641184), kapital hälsa forskning och utveckling av särskilda projekt i Peking (nr 2011-1013-03), fondens öppnandet av Beijing nyckel laboratorium miljötoxikologi (# 2015HJDL03), och naturvetenskap Foundation i Shandong-provinsen, Kina (ZR2017BF041).

Materials

Name Company Catalog Number Comments
2-Propanol Sigma-Aldrich 59300
384-well plates Throme 142761
Agar Bacto 214010
Atropine sulfate Sigma-Aldrich PHL80892
Bleach buffer 0.5 mL of 10 M NaOH, 0.5 mL of5% NaClO, 9 mL ofultrapure water
Cadmium chloride Sigma-Aldrich 202908
Calcium chloride Sigma-Aldrich 21074
CCD camera Zeiss AxioCam HRm Zeiss microscopy GmbH
Cholesterol Sigma-Aldrich C8667
Copper(II) sulfate Sigma-Aldrich 451657
Ethanol Sigma-Aldrich 24105
Ethylene glycol Sigma-Aldrich 324558
Glycerol Sigma-Aldrich G5516
K-Medium 3.04 g of NaCl and 2.39 g of KCl in 1 L ultrapure water
LB Broth  10 g/L Tryptone, 5 g/L Yeast Extract, 5 g/L NaCl 
Magnesium sulfate heptahydrate Sigma-Aldrich 63140
NGM Plate 3 g ofNaCl, 17 g ofagar, 2.5 g ofpeptone in 1 L of ultrapure water, after autoclave add 1 mL of cholesterol (5 mg/mL in ethanol), 1 mL of MgSO4 (1 M), 1 mL of CaCl2 (1 M), 25 mL of PPB buffer
Peptone Bacto 211677
Potassium chloride Sigma-Aldrich 60130
Potassium phosphate dibasic Sigma-Aldrich 795496
Potassium phosphate monobasic Sigma-Aldrich 795488
PPB buffer 35.6 g of K2HPO4, 108.3 g of KH2PO4 in 1 L ultrapure water
shaker ZHICHENG ZWY-200D
Sodium chloride Sigma-Aldrich 71382
Sodium fluoride Sigma-Aldrich s7920
Sodium hydroxide Sigma-Aldrich 71690
Sodium hypochlorite solution Sigma-Aldrich 239305
The link of program https://github.com/weiyangc/ImageProcessForWellPlate
Tryptone Sigma-Aldrich T7293
Yeast extract Sigma-Aldrich Y1625
Zeiss automatic microscope  Zeiss AXIO Observer.Z1 Zeiss automatic microsco with peproprietary software Zen2012 and charge coupled device(CCD) camera

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Anderson, G. L., et al. Assessing behavioral toxicity with Caenorhabditis elegans. Environmental Toxicology and Chemistry. 23 (5), 1235-1240 (2004).
  2. Boyd, W. A., et al. A high-throughput method for assessing chemical toxicity using a Caenorhabditis elegans reproduction assay. Toxicology and Applied Pharmacology. 245 (2), 153-159 (2010).
  3. Boyd, W. A., Williams, P. L. Comparison of the sensitivity of three nematode species to copper and their utility in aquatic and soil toxicity tests. Environmental Toxicology and Chemistry. 22 (11), 2768-2774 (2003).
  4. Dengg, M., van Meel, J. C. Caenorhabditis elegans as model system for rapid toxicity assessment of pharmaceutical compounds. Journal of Pharmacological and Toxicological Methods. 50 (3), 209-214 (2004).
  5. Schouest, K., et al. Toxicological assessment of chemicals using Caenorhabditis elegans and optical oxygen respirometry. Environmental Toxicology and Chemistry. 28 (4), 791-799 (2009).
  6. Sprando, R. L., et al. A method to rank order water soluble compounds according to their toxicity using Caenorhabditis elegans, a Complex Object Parametric Analyzer and Sorter, and axenic liquid media. Food and Chemical Toxicology. 47 (4), 722-728 (2009).
  7. Wang, D., Xing, X. Assessment of locomotion behavioral defects induced by acute toxicity from heavy metal exposure in nematode Caenorhabditis elegans. Journal of Environmental Sciences (China). 20 (9), 1132-1137 (2008).
  8. Leung, M. C., et al. Caenorhabditis elegans: an emerging model in biomedical and environmental toxicology. Toxicological Sciences. 106 (1), 5-28 (2008).
  9. Li, Y., et al. Correlation of chemical acute toxicity between the nematode and the rodent. Toxicology Research. 2 (6), 403-412 (2013).
  10. Boyd, W. A., et al. Effects of genetic mutations and chemical exposures on Caenorhabditis elegans feeding: evaluation of a novel, high-throughput screening assay. PLoS One. 2 (12), 1259 (2007).
  11. Xian, B., et al. WormFarm: a quantitative control and measurement device toward automated Caenorhabditis elegans aging analysis. Aging Cell. 12 (3), 398-409 (2013).
  12. Gao, S., et al. Classification and prediction of toxicity of chemicals using an automated phenotypic profiling of Caenorhabditis elegans. BMC Pharmacology and Toxicology. 19 (1), 18 (2018).
  13. Moyson, S., et al. Mixture effects of copper, cadmium, and zinc on mortality and behavior of Caenorhabditis elegans. Environmental Toxicology and Chemistry. 37 (1), 145-159 (2018).
  14. Wang, X., et al. Lifespan extension in Caenorhabditis elegans by DMSO is dependent on sir-2.1 and daf-16. Biochemical and Biophysical Research Communications. 400 (4), 613-618 (2010).
  15. Boyd, W. A., et al. Developmental Effect of the ToxCast Phase I and Phase II Chemicals in Caenorhabditis elegans and Corresponding Responses in Zebrafish, Rats, and Rabbits. Environmental Health Perspectives. 124 (5), 586-593 (2016).

Tags

Miljövetenskap fråga 145 kemikalier toxicitet Caenorhabditis elegans bildanalys fenotyp kvantifiering
En hög genomströmning analys för Prediktion av kemiska toxiciteten av automatiserad fenotypiska profilering av <em>Caenorhabditis elegans</em>
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Gao, S., Chen, W., Zhang, N., Xu,More

Gao, S., Chen, W., Zhang, N., Xu, C., Jing, H., Zhang, W., Han, G., Flavel, M., Jois, M., Zeng, Y., Han, J. D. J., Xian, B., Li, G. A High-throughput Assay for the Prediction of Chemical Toxicity by Automated Phenotypic Profiling of Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (145), e59082, doi:10.3791/59082 (2019).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter