Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Environment

En høy gjennomstrømming analysen for prediksjon av kjemiske giftighet av automatisert fenotypiske profilering av Caenorhabditis elegans

Published: March 14, 2019 doi: 10.3791/59082
* These authors contributed equally

Summary

Kvantitativ metode er utviklet for å identifisere og forutsi Akutt toksisitet av kjemikalier ved å automatisk analysere fenotypiske profilering av Caenorhabditis elegans. Denne protokollen beskriver hvordan å behandle ormer med kjemikalier i en 384-vel plate, fange video og kvantifisere toksikologiske relaterte fenotyper.

Abstract

Bruk toksisitet testing av kjemikalier i høyere orden organismer, som mus eller rotter, er tidkrevende og kostbar, deres lang levetid og vedlikeholdsproblemer. Tvert imot, Rundormer Caenorhabditis elegans (C. elegans) har fordeler å gjøre det et ideelt valg for toksisitet testing: en kort levetid, lett dyrking og effektiv gjengivelse. Her beskriver vi en protokoll for automatisk fenotypiske profilering C. elegans i en 384-vel plate. Rundormer ormer er kultivert i en 384-vel plate med flytende medium og kjemisk behandling, og videoer er tatt av hver brønn å kvantifisere kjemiske påvirkning på 33 ormen funksjoner. Eksperimentelle resultater viser at funksjonene kvantifisert fenotypen kan klassifisere og forutsi Akutt toksisitet for ulike kjemiske forbindelser og opprette en prioritet for mer tradisjonelle kjemiske giftighet vurdering tester i en gnager modell.

Introduction

Sammen med den raske utviklingen av kjemiske forbindelser på industriell produksjon og folks daglige liv, er det viktig å studere toksisitet testing modeller for kjemikalier. I mange tilfeller er den gnager dyremodell ansatt å vurdere den potensielle toksisitet av ulike kjemikalier på helse. Vanligvis er bestemmelse av dødelige konsentrasjoner (dvs. assayed 50% dødelig dose [LD50] ulike kjemikalier) brukt som tradisjonelle parameteren i en gnager (rotte/mus) modell i vivo, som er tidkrevende og svært dyre. Dessuten, på grunn av redusere, avgrense eller erstatte (3R) prinsipp som er sentrale for dyrevelferd og etikk, nye metoder som tillater utskifting av dyr er verdifulle forskning1,2,3 . C. elegans er et frittlevende Rundormer som er isolert fra jord. Det har vært mye brukt som en forskning organisme i laboratoriet på grunn av sin fordelaktige egenskaper, som kort lifespan, lett dyrking og effektiv gjengivelse. I tillegg er mange grunnleggende biologiske banene, inkludert grunnleggende fysiologiske prosesser og stressresponser i C. elegans, bevart i høyere pattedyr4,5,6,7 , 8. et par sammenligninger vi og andre har gjort, det er en god samsvar mellom C. elegans giftighet og toksisitet i gnagere9. Alt dette gjør C. elegans en god modell for å teste effekten av kjemiske toksisitet i vivo.

Nylig kvantifisert noen studier fenotypiske funksjonene C.elegans. Funksjonene kan brukes å analysere toksisitet av kjemikalier2,3,10 og aldring av ormer11. Vi har også utviklet en metode som kombinerer en flytende orm dyrking og et bilde analyse systemet, der ormer er kultivert i en 384-vel plate under forskjellige kjemiske behandlinger12. Dette kvantitativ teknikk er utviklet for å automatisk analysere 33 parameterne C. elegans etter 12-24h kjemisk behandling i en 384-vel plate med flytende medium. En automatisert mikroskop scenen brukes for eksperimentelle video oppkjøpet. Videoene er behandlet av en tilpasset designet program og 33 funksjoner for ormer flytte atferd er kvantifisert. Metoden er brukt om å kvantifisere av ormen fenotyper under behandling av 10 forbindelser. Resultatene viser at ulike toksisitet kan endre av fenotyper C.elegans. Disse kvantifisert fenotyper kan brukes til å identifisere og forutsi Akutt toksisitet av ulike kjemiske forbindelser. Det overordnede målet med denne metoden er å tilrettelegge for observasjon og fenotypiske kvantifisering eksperimenter med C. elegans i en. Denne metoden er nyttig for programmet C. elegans kjemiske giftighet evalueringer og fenotypen quantifications, som hjelper forutse Akutt toksisitet av ulike kjemiske forbindelser og opprette en prioritet for mer tradisjonelle kjemiske giftighet vurdering tester i en gnager modell. I tillegg kan denne metoden brukes toksisitet screening og testing av nye kjemikalier eller sammensatte som mat additiv agent forurensning, pharmacautical forbindelser, miljømessige eksogene sammensatte og så videre.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

Protokollen følger retningslinjene som dyr pleie av dyr etikk Beijing sentrum for sykdomsforebygging og kontroll i Kina.

1. kjemisk forberedelse

  1. Få kjemikalier (tabell 1 og Tabell for materiale).
  2. Angi høyeste og laveste dosering av personlige kjemikalier for en minimum konsentrasjon av 100% dødelighet (LC100, 24 h) og en maksimal konsentrasjon av 100% nonlethality (LC0, 24 h) til ormer. Bruk minst seks fortynninger av den høyeste konsentrasjonen (tabell 1).
    Merk: Gjennomføre foreløpige ormen dødelighet testen9 for å utforske LC100 og LC0 for en ny kjemiske, for å finne dosen.
  3. Fortynn hver kjemisk med K-medium (Tabell for materiale) 2 x nødvendig konsentrasjon. Bruke K-medium som en kontroll sammenligne fenotypen omleggingene forårsaket av kjemikalier.
    1. For eksempel Forbered 7 gradient konsentrasjoner av kadmium klorid (CdCl2) (tabell 1). For å forberede 2 x den høyeste konsentrert vannløsning (4.64 mg/mL), løses 92.8 mg CdCl2 solid pulver i 8 mL av K-medium og fylle opp til 10 mL etter at pulveret er fullstendig oppløst. Forberede de andre konsentrasjonen nivåene av fortynning med K-medium.
  4. Forbered åtte parallelle brønner for hver konsentrasjon i kjemisk forløpningen. Hver inneholder også 50 µL av 2 x kjemisk løsning. Forbered minst tre grupper av åtte parallelle brønner på K-medium som kontroller (tabell 2).
    Merk: I korte trekk et volum på 500 µL av 2 x fungerende løsning er nødvendig for en enkelt dose av hver kjemisk.

2. ormen forberedelse

  1. Få vill-type N2 ormer og Escherichia coli OP50 stammer fra Caenorhabditis genetikk Center (CGC).
  2. Få synkronisert L4 ormer.
    1. Velg en enkelt koloni av E. coli OP50 fra strek plate. Tas aseptisk vaksinere kolonien i 100 mL LB buljong og vokse over natten på 37 ° C.
      Merk: E. coli OP50 løsningen er nå klar for såing til Rundormer vekst medium (NGM, Tabell for materiale) plater.
    2. Hell NGM i en 90 mm plast Petri plate. Frø hver plate med 300 µL av E. coli OP50 løsning dagen etter pouring. Inkuber N2 ormer på NGM plater med OP50 ved 20 ° C i ca 2-3 dager til de fleste av ormer har nådd det voksne stadiet.
    3. Høste gravid ormer i en 15 mL steril konisk sentrifuge rør med sterilt H2O. La ormer slå seg ned i minst 2 minutter, Sug opp den H2O og legge 5 mL av blekemiddel buffer (Tabell for materiale).
    4. Vortex tube i 5 min, spin røret for 30 s (på 1300 x g) pellets egg, og forkaste nedbryting.
    5. Vask eggene med 5 mL steril H2O og vortex tube for 5 s. sentrifuge røret for 30 s (på 1300 x g), Fjern nedbryting og vask igjen.
    6. Pipetter egg på en ny NGM tallerken med OP50. Inkuber dem på 20 ° C. Overvåke skravert L1 ormer neste morgen; ormer kommer L4 scenen i ca 40 timer.
  3. Vask L4 ormer av 90 mm Petri platene med K-medium i en 50 mL steril konisk rør. Justere konsentrasjonen av ormer til ~ 40 dyr per 100 µL av K-medium under en stereomicroscope. Legge til 50 µL (~ 20 ormer) i hver brønn av 384-vel plate. Disse synkronisert ormer (L4 scenen) er klar for følgende behandling av kjemikalier.

3. kjemisk behandling og videoopptak

Merk: I en 384-vel plate, ormer (50 µL i hver brønn) er behandlet til seks til syv doser av en individuell kjemiske (tabell 1). Forbered åtte parallelle brønner, hver med 50 µL av 2 x kjemisk løsning for hver dosering (åtte brønner er fylt med det samme kjemiske og samme konsentrasjonen, tabell 2). Alle videoer er samlet inn ved hjelp av et digitalt kamera koblet til en invertert mikroskopet (Tabell for materiale). Kjemisk behandling eksperimentet varer i 24 timer. Ikke Legg bakteriell mat hver brønn under 24 h kjemisk behandling eksperimentet.

  1. Før du legger til kjemikalier, sett 384-vel platen med ormene synkronisert på automatisk scenen og ta videoer av hver brønn programmert oppkjøpet fremgangsmåten (7 rammens per andre for 2 s; tar ~ 25 minutter å skanne hver plate).
  2. Legge til 50 µL av 2 x kjemiske lager utarbeidet etter inndeling 1 for hver brønn (tabell 2). Angi tiden som 0 h.
  3. Inkuber 384-vel platen ved 20 ° C og rist den på 80 rpm i en inkubator shaker.
  4. Fjerne platen fra inkubator og overføre den til en automatisk scene. Ta videoer av hver brønn av hele platen, på 12t og 24 h, sjekke av fenotyper av ormene for hver bestemt kjemisk behandling i K-medium. Ca 25 min kreves for en plate skjerm.

4. eksperiment videobehandling

Merk: Et program for eksperimentell video og bilder behandling ble skrevet og pakket. Det kan fritt lastes (se Tabellen for materiale). Eksperimentell video er lagret i form av en bildesekvens rammen og rammen sekvensen av hver video er lagret i en bestemt mappe. Programmet kan gjenkjenne ormer og kvantifisere fenotyper automatisk.

  1. I det grafiske brukergrensesnittet (GUI, figur 1), Legg parametere, for eksempel mappen ramme sekvens, utdatamappen, ormen Størrelsesparameteren og bevegelse threshold-parameteren. Klikk analyser for å behandle de eksperimentelle bildene.
    1. Klikk Velg for å velge bilder kildemappen.
    2. Legge til midten resultatet katalog i grensesnittet.
      Merk: Midten resultatene inkludere segmentert bildene. Disse midten resultatene er nyttig for visuell observasjon av bearbeidet bildene.
    3. Legge til resultatet katalogen i grensesnittet.
    4. Legge til gjennomsnittlig ormen størrelsesparameter i Ormen størrelse tekstboksen i grensesnittet.
      Merk: Parameteren size brukes i forsøkene er 2000.
    5. Legge til terskelen av flyttet forhold i grensesnittet.
      Merk: Brukes i forsøkene er 0.93.
    6. Klikk på analyser -knappen for å starte bildebehandlingen. Klikk Tilbakestill for å fjerne lagt parameterne .
      Merk: Det er 33 funksjoner definert og kvantifisert for ormer. Alle de definerte fenotyper er sortert etter kategorier (oppført i tabell 3). Disse funksjonene kan kvantifiseres fra experimental bilder. En kvantitativ sammenligning mellom ulike kjemikalier, som har ulike toksisitet, kan gjøres ved å sammenligne disse funksjonene.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Vi har testet av fenotyper ormer utsatt for ulike konsentrasjoner av mer enn 10 kjemikalier12. I testen kvantifisert 33 forskjellige funksjoner for hver kjemisk ved tre tidspunkt (0 h, 12t og 24 h). En sammenligning mellom en håndbok og en automatisk analyse av en levetid analysen var tidligere gjort11,12. I denne analysen fant vi at kjemikalier og konsentrasjoner kan påvirke av ormen fenotyper. En oversikt over denne metoden er vist i figur 2.

Resultatene (Figur 3 og Figur 4c, d) viste at ormer døde raskt som kjemisk konsentrasjonen økt. I høyere konsentrasjoner ormer ble rettere og mindre buet enn i lave konsentrasjoner eller kontroll grupper (Figur 3 og Figur 4b). I begynnelsen (på 0 h) var det ingen signifikant forskjell mellom kontroll (K-medium) og kjemiske behandlinger for alle fenotyper. Etter 12 h behandling med en gitt kjemiske dosering, fenotyper ormer viste ulike grader av forskjeller mellom kontrollen og annen konsentrasjon grupper. For eksempel store lengden økes som økt. Det er også en gradient trend fra lavere til høyere kjemiske konsentrasjoner. Gradient utviklingen av ulike kjemiske konsentrasjoner var også betydelig mindre aksen lengden (Figur 4a, b).

I denne analysen beregnet ormen motilitet på to måter, basert på området ormen flyttet og motilitet forholdet (Figur 4c, d). Motilitet resultatene av begge veier viste lignende mønstre. Det var ingen vesentlig forskjell av ormen motilitet blant ulike konsentrasjoner og kontroll grupper i begynnelsen (på tidspunktet 0t). Ettersom tiden gikk, nedgang ormer i kontroll grupper viste en stabil i motilitet. På 12 h, ormene som gjennomgikk kjemiske behandlinger i ulike konsentrasjoner viste betydelige forskjeller i motilitet sammenlignet med kontroll grupper. I tillegg viste ormer under høyere konsentrasjon behandlinger svak motilitet sammenlignet med ormer under lavere konsentrasjon behandlinger. Dette indikerer at ormer under høyere konsentrasjon behandlinger ble mindre motile og døde raskere (Figur 4c, d). Disse resultatene tyder på at designet metoden er nyttig for kjemiske giftighet vurderinger og kvantifisert fenotyper C. elegans er nyttige indikatorer for kjemiske giftighet identifikasjon.

Figure 1
Figur 1 : Grensesnittet for programvaren. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.

Figure 2
Figur 2 : En høy gjennomstrømming analysen for prediksjon av kjemiske giftighet av automatiserte fenotypiske profilering av Caenorhabditis eleganspipeline. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.

Figure 3
Figur 3 : Eksperimentell bilder av ormer under 4.64 mg/mL CdCl2 (øvre panel), 0.464 mg/mL CdCl2 (midten panel) og K-middels (nedre panelet), på forskjellige tidspunkt. Bildene viser statusen endres av ormer under kjemisk behandling eller i en kontrollgruppe i en representant godt av 384-vel platen hele tiden. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.

Figure 4
Figur 4 : Kvantifisert funksjonene av ormer under ulike konsentrasjoner av CdCl2. (en) hvor kvantifisert hovedakse. (b) hvor kvantifisert lille akse. (c) kvantifisert motilitet av trekket området. (d) kvantifisert motilitet av trekket området/orm størrelse. Baren tomter Vis gjennomsnittlig kvantifiseringen for hver funksjon på enkelt ormer. Feilfeltene betegne ± standardavviket (SD). Konsentrasjon enheten = mg/mL. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.

Table 1
Tabell 1: eksponering konsentrasjon av 10 kjemikalier for 384-vel-plate C. elegans Akutt toksisitet test

Table 2
Tabell 2: En skjematisk av oppsettet 384-vel plate.

Table 3
Tabell 3: Definert fenotyper ormer.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Fordelene med C. elegans har ført til økende bruk i toksikologi9, både mekanistisk studier og høy gjennomstrømming screening tilnærminger. En øket rolle for C. elegans i utfyller andre modellsystemer i toksikologiske forskning har vært bemerkelsesverdig de siste årene, spesielt for rask toksisitet vurdering av nye kjemikalier. Denne artikkelen inneholder en ny analysen av høy gjennomstrømning og kvantitative screening av ormen fenotyper i en 384-vel plate for automatisk identifikasjon og vurdering av kjemiske giftighet. Denne analysen er ideell for Akutt toksisitet testing av kjemikalier innen 24 timer, og det kan brukes til subakutt toksisitet testing også når mer tid datapunktene samles og matkilde (OP50) angis for ormer.

Mediet som brukes for fortynne kjemikalier kan variere; Vi valgte K-medium i analysen ved å henvise til Sofieet al. 13. ormer ble dyrket i K-medium i både kontrollen og kjemisk behandlingsgrupper. En kunstig ferskvann løsning eller en jord løsning med lav ioniske styrke kunne alternativer til K-medium.

Kjemikalier med forskjellige toksisitet kan endre av fenotyper C. elegans i ulike mønstre. Kjemikalier som brukes i denne testen ble valgt fra tredje til sjette kategorier av globalt harmoniserte System for klassifisering og merking av kjemikalier (GHS). C. elegans ble utsatt for kjemikalier i seks eller flere doser nivåer, som dekket området 0% - 100% dødelighet dosering. DMSO anbefales for de kjemikaliene med lav vannløselighet, å fremme kjemiske oppløsningen i vann. Som en høy konsentrasjon av DMSO kan påvirke ormen utvikling og levetid14, bør ikke mer enn 0,2% DMSO brukes for vannlevende tester.

Funksjonene for automatisk kvantifisert viser betydelig forskjell blant annet toksisitet, som viser at disse kvantifisert fenotyper ormer er svært nyttige i å identifisere toksisitet av kjemikalier. Indikerte at fenotypiske profilering åpenbart bevarte funksjoner til å klassifisere og forutsi giftigheten av ulike kjemikalier med Rundormer C. elegans som en i vivo modell organisme.

Den amerikanske nasjonale toksikologi Program (NTP) etablert Tox21 samfunnet gjennom en memorandum of understanding med US Environmental Protection Agency (EPA) og National Institutes of Health (NIH) kjemiske Genomics Center, nå National Center for Fremme translasjonsforskning Sciences (NCATS). Tox21 bruker høy gjennomstrømming i vitro screening og i vivo alternativ dyremodell testing for å identifisere virkningsmekanismer toksisitet, prioritere kjemikalier for ytterligere i vivo toksisitet testing og å utvikle prediktive modeller av menneskelig toksikologiske svar. Som en del av denne innsatsen, ble C. elegans brukt til skjerm EPA ToxCast fasen jeg og fase II biblioteker, som inneholder 292 og 676 kjemikalier, henholdsvis for kjemikalier fører til redusert larver utvikling og vekst15. COPAS (sammensatt objekt parametrisk Analyzer og Sorter) plattformen har også blitt brukt for ormen toksikologisk screening studier2. Imidlertid kvantifiserer COPAS plattformen bare noen funksjoner, for eksempel ormen bredde, ormen lengde og fluorescens intensiteten. Denne metoden er en forbedring gjeldende metoder med ormer å raskt prescreen toksisitet av nye kjemikalier.

Det er flere viktige trinn i protokollen: ormen kulturen i en 384-vel plate, kjemisk behandling, det eksperimentelle bildeoppløsning og fenotypen kvantifisering. Sammenlignet med tradisjonelle toksisitet evalueringsmetoder, kan denne protokollen kvantifisere noen fenotyper ormer som er vanskelig å beregne manuelt og nyttig å reflektere toksisitet av alle kjemiske, som ormen motilitet, ormen bredde, ormen størrelse og grå intensitet. Tydelig, denne høy gjennomstrømming analysen for prediksjon av kjemiske giftighet blir en verdifull toksisitet modell tilnærming og kan brukes til prescreening av kjemikalier før gnager dyreforsøk.

I sammendraget baner denne teknikken måte rask toksisitet vurdering i flere områder. Forskere kan bruke metoden beredskap analyse av toksisitet i infeksjon toxicosis, sikkerhet evalueringen av farmasøytiske forbindelser, så vel som Akutt toksisitet screening og oppdagelsen av nye kjemikalier og miljømessige eksogene forbindelser.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Forfatterne ikke avsløre.

Acknowledgments

Forfatterne takker CGC for vennlige sende den C. elegans. Dette arbeidet ble støttet av National nøkkelen forskning og utvikling Program i Kina (#2018YFC1603102, #2018YFC1602705); National Natural Science Foundation Capital Health Research og utvikling av spesialprosjekt i Beijing (#2011-1013-03), fondet åpningen av Beijing nøkkel Laboratory miljø toksikologi (# Kina Grant (#31401025, #81273108, #81641184) 2015HJDL03), og Natural Science Foundation i Shandong i Folkerepublikken Kina (ZR2017BF041).

Materials

Name Company Catalog Number Comments
2-Propanol Sigma-Aldrich 59300
384-well plates Throme 142761
Agar Bacto 214010
Atropine sulfate Sigma-Aldrich PHL80892
Bleach buffer 0.5 mL of 10 M NaOH, 0.5 mL of5% NaClO, 9 mL ofultrapure water
Cadmium chloride Sigma-Aldrich 202908
Calcium chloride Sigma-Aldrich 21074
CCD camera Zeiss AxioCam HRm Zeiss microscopy GmbH
Cholesterol Sigma-Aldrich C8667
Copper(II) sulfate Sigma-Aldrich 451657
Ethanol Sigma-Aldrich 24105
Ethylene glycol Sigma-Aldrich 324558
Glycerol Sigma-Aldrich G5516
K-Medium 3.04 g of NaCl and 2.39 g of KCl in 1 L ultrapure water
LB Broth  10 g/L Tryptone, 5 g/L Yeast Extract, 5 g/L NaCl 
Magnesium sulfate heptahydrate Sigma-Aldrich 63140
NGM Plate 3 g ofNaCl, 17 g ofagar, 2.5 g ofpeptone in 1 L of ultrapure water, after autoclave add 1 mL of cholesterol (5 mg/mL in ethanol), 1 mL of MgSO4 (1 M), 1 mL of CaCl2 (1 M), 25 mL of PPB buffer
Peptone Bacto 211677
Potassium chloride Sigma-Aldrich 60130
Potassium phosphate dibasic Sigma-Aldrich 795496
Potassium phosphate monobasic Sigma-Aldrich 795488
PPB buffer 35.6 g of K2HPO4, 108.3 g of KH2PO4 in 1 L ultrapure water
shaker ZHICHENG ZWY-200D
Sodium chloride Sigma-Aldrich 71382
Sodium fluoride Sigma-Aldrich s7920
Sodium hydroxide Sigma-Aldrich 71690
Sodium hypochlorite solution Sigma-Aldrich 239305
The link of program https://github.com/weiyangc/ImageProcessForWellPlate
Tryptone Sigma-Aldrich T7293
Yeast extract Sigma-Aldrich Y1625
Zeiss automatic microscope  Zeiss AXIO Observer.Z1 Zeiss automatic microsco with peproprietary software Zen2012 and charge coupled device(CCD) camera

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Anderson, G. L., et al. Assessing behavioral toxicity with Caenorhabditis elegans. Environmental Toxicology and Chemistry. 23 (5), 1235-1240 (2004).
  2. Boyd, W. A., et al. A high-throughput method for assessing chemical toxicity using a Caenorhabditis elegans reproduction assay. Toxicology and Applied Pharmacology. 245 (2), 153-159 (2010).
  3. Boyd, W. A., Williams, P. L. Comparison of the sensitivity of three nematode species to copper and their utility in aquatic and soil toxicity tests. Environmental Toxicology and Chemistry. 22 (11), 2768-2774 (2003).
  4. Dengg, M., van Meel, J. C. Caenorhabditis elegans as model system for rapid toxicity assessment of pharmaceutical compounds. Journal of Pharmacological and Toxicological Methods. 50 (3), 209-214 (2004).
  5. Schouest, K., et al. Toxicological assessment of chemicals using Caenorhabditis elegans and optical oxygen respirometry. Environmental Toxicology and Chemistry. 28 (4), 791-799 (2009).
  6. Sprando, R. L., et al. A method to rank order water soluble compounds according to their toxicity using Caenorhabditis elegans, a Complex Object Parametric Analyzer and Sorter, and axenic liquid media. Food and Chemical Toxicology. 47 (4), 722-728 (2009).
  7. Wang, D., Xing, X. Assessment of locomotion behavioral defects induced by acute toxicity from heavy metal exposure in nematode Caenorhabditis elegans. Journal of Environmental Sciences (China). 20 (9), 1132-1137 (2008).
  8. Leung, M. C., et al. Caenorhabditis elegans: an emerging model in biomedical and environmental toxicology. Toxicological Sciences. 106 (1), 5-28 (2008).
  9. Li, Y., et al. Correlation of chemical acute toxicity between the nematode and the rodent. Toxicology Research. 2 (6), 403-412 (2013).
  10. Boyd, W. A., et al. Effects of genetic mutations and chemical exposures on Caenorhabditis elegans feeding: evaluation of a novel, high-throughput screening assay. PLoS One. 2 (12), 1259 (2007).
  11. Xian, B., et al. WormFarm: a quantitative control and measurement device toward automated Caenorhabditis elegans aging analysis. Aging Cell. 12 (3), 398-409 (2013).
  12. Gao, S., et al. Classification and prediction of toxicity of chemicals using an automated phenotypic profiling of Caenorhabditis elegans. BMC Pharmacology and Toxicology. 19 (1), 18 (2018).
  13. Moyson, S., et al. Mixture effects of copper, cadmium, and zinc on mortality and behavior of Caenorhabditis elegans. Environmental Toxicology and Chemistry. 37 (1), 145-159 (2018).
  14. Wang, X., et al. Lifespan extension in Caenorhabditis elegans by DMSO is dependent on sir-2.1 and daf-16. Biochemical and Biophysical Research Communications. 400 (4), 613-618 (2010).
  15. Boyd, W. A., et al. Developmental Effect of the ToxCast Phase I and Phase II Chemicals in Caenorhabditis elegans and Corresponding Responses in Zebrafish, Rats, and Rabbits. Environmental Health Perspectives. 124 (5), 586-593 (2016).

Tags

Miljøfag problemet 145 kjemikalier toksisitet Caenorhabditis elegans bildeanalyser fenotype kvantifisering
En høy gjennomstrømming analysen for prediksjon av kjemiske giftighet av automatisert fenotypiske profilering av <em>Caenorhabditis elegans</em>
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Gao, S., Chen, W., Zhang, N., Xu,More

Gao, S., Chen, W., Zhang, N., Xu, C., Jing, H., Zhang, W., Han, G., Flavel, M., Jois, M., Zeng, Y., Han, J. D. J., Xian, B., Li, G. A High-throughput Assay for the Prediction of Chemical Toxicity by Automated Phenotypic Profiling of Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (145), e59082, doi:10.3791/59082 (2019).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter