Summary
I protocolli qui descritti forniscono una guida per visualizzare e quantificare l'attività delle proteasi neutrofile nell'espettorato umano. Le applicazioni di tale analisi spaziano dalla valutazione dei trattamenti antinfiammatori, alla convalida del biomarcatore, allo screening farmacologico e agli studi clinici di coorte di grandi dimensioni.
Abstract
Le proteasi sono regolatori di innumerevoli processi fisiologici e l'indagine precisa delle loro attività rimane un'intrigante sfida biomedica. Tra le ~600 proteasi codificate dal genoma umano, le proteasi della serina neutrofila (NSP) sono accuratamente studiate per il loro coinvolgimento nell'insorgenza e nella progressione di condizioni infiammatorie comprese le malattie respiratorie. Gli NSP secreti in modo univoco non solo si diffondono all'interno dei fluidi extracellulari, ma si localizzano anche nelle membrane plasmatiche. Durante la formazione di trappola extracellulare neutrofila (NET), gli NSP diventano parte integrante della cromatina secreta. Un comportamento così complesso rende la comprensione della fisiopatologia degli NSP un compito impegnativo. Qui, vengono mostrati protocolli dettagliati per visualizzare, quantificare e discriminare le attività di elastasi neutrofila libera e legata alla membrana (NE) e catepsina G (CG) nei campioni di espettorato. NE e CG sono NSP le cui attività hanno ruoli pleiotropici nella patogenesi della fibrosi cistica (CF) e della broncopneumopatia cronica ostruttiva (BPCO): promuovono il rimodellamento dei tessuti, regolano le risposte immunitarie a valle e sono correlate con la gravità della malattia polmonare. I protocolli mostrano come separare fluido e frazione cellulare, così come l'isolamento dei neutrofili dall'espettorato umano per la quantificazione dell'attività enzimatica attraverso i giornalisti basati sul trasferimento di energia a risonanza di Förster (FRET) a piccole molecole. Per raccogliere approfondimenti specifici sul ruolo relativo delle attività NE e CG, una lettura FRET può essere misurata da diverse tecnologie: i) le misurazioni del lettore di lastre in vitro consentono un'elevata produttività e il rilevamento alla rinfusa dell'attività proteasi; ii) la microscopia confocale risolve temporaneamente l'attività legata alla membrana sulla superficie cellulare; iii) la citometria a flusso FRET a piccole molecole consente una rapida valutazione dei trattamenti antinfiammatori attraverso la quantificazione e la fenotipizzazione dell'attività proteasi a singola cellula. L'attuazione di tali metodi apre le porte all'esplorazione della patobiologia degli NSP e del loro potenziale come biomarcatori della gravità della malattia per CF e BPCO. Dato il loro potenziale di standardizzazione, la loro robusta lettura e semplicità di trasferimento, le tecniche descritte sono immediatamente condividibili per l'implementazione tra laboratori di ricerca e diagnostica.
Introduction
L'elastasi neutrofila (NE), la catepsina G (CG), la proteinasi 3 (PR3) e la proteasi della serina neutrofila 4 (NSP4) sono le quattro proteasi della serina neutrofila (NSP)1. Sono conservati, insieme alla mieloperossidasi, all'interno di granuli primari neutrofili o azurofili. A causa del loro elevato contenuto proteolitico, la secrezione di granuli primari è strettamente regolata e i neutrofili devono essere sfidati in sequenza con l'adescamento e l'attivazione distimoli 2.
All'interno del fagolysosoma, gli NSP funzionano come agenti battericidi intracellulari3. Se secreti, gli NSP diventano forti mediatori dell'infiammazione: scindono citochine e recettori superficiali, attivando vie pro-infiammatorie parallele3. È importante sottolineare che le condizioni infiammatorie presentano una secrezione incontrollata di NSP. Ad esempio, all'interno delle vie aeree infiammate, un'eccessiva attività NE causa ipersecrezione del muco, metaplasia delle cellule calice, inattivazione CFTR e rimodellamento della matrice extracellulare4,5. La catepsina G partecipa anche all'infiammazione: si stacca e attiva specificamente due componenti della famiglia IL-1, IL-36α e IL-36β6. Di concerto con NE, CG scicca i recettori attivati dalla proteasi sull'epitelio delle vie aeree e attiva anche TNF-α e IL-1β.
Le anti-proteasi endogene come alfa-1-antitripsina, alfa-1-antichimotripsina e l'inibitore della proteasi leucocitaria secretoria regolano l'attività neutrofila e l'attività G della catepsina5. Tuttavia, nel corso della progressione della malattia polmonare, la secrezione continua di proteasi supera stechiometricamente lo scudo anti-proteasi, portando a neutrofilia non risolutiva nelle vie aeree, peggioramento dell'infiammazione e danni aitessuti 5,7. Sebbene la concentrazione e l'attività ne in frazioni solubili delle vie aeree del paziente si siano dimostrate un promettente biomarcatore della gravitàdella malattia 8, NE e CG si associano anche alla membrana plasmatica neutrofila e al DNA extracellulare attraverso interazioni elettrostatiche9,10 dove diventano meno accessibili alle anti-proteasi. È importante sottolineare che studi preclinici hanno definito uno scenario in cui l'attività proteasi associata alla superficie cellulare appare prima e/o indipendentemente dalla contropartesolubile 4,11. Infatti, per diventare rilevabile, l'attività proteasi libera deve prima sopraffare lo scudo anti-proteasi. Invece, sulla superficie cellulare, l'attività proteasi legata alla membrana rimane almeno parzialmente intatta a causa dell'inaccessibilità di grandi inibitori alla membrana plasmaticacellulare 12. Tale comportamento proteasi complesso ha importanti conseguenze sull'insorgenza e la propagazione dell'infiammazione mediata dai neutrofili e quindi deve essere studiato con strumenti precisi e informativi.
Nel corso degli anni, le sonde basate sul trasferimento di energia di risonanza di Förster (FRET) hanno trovato numerose applicazioni biomediche come strumenti che valutano in modo efficiente e rapido una specifica attività proteasi nei campioniumani 13. Per funzionare, i reporter proteasi sono composti da un motivo di riconoscimento (cioè un peptide), che è riconosciuto dall'enzima bersaglio e si basa su FRET, un processo fisico in cui, all'eccitazione, un fluoroforo donatore trasferisce energia a una molecola accettore. La lavorazione operata dall'enzima sul reporter, vale a dire la scissione della parte di riconoscimento, fa in modo che l'accettore si disffondoni dal donatore: l'attività enzimatica viene quindi misurata come un cambiamento dipendente dal tempo nel donatore rispetto alla fluorescenza accettore. Tale lettura è auto-normalizzante e ratiometrica, quindi solo marginalmente influenzata da condizioni ambientali come il pH e la concentrazione di sonde locali. NEmo-114 e sSAM15 sono sonde FRET che riportano specificamente l'attività NE e CG, rispettivamente. Tuttavia, tali giornalisti non si localizzano specificamente in alcun compartimento cellulare, quindi sono impiegati per monitorare l'attività proteasi presente nei fluidi umani. Al fine di monitorare l'attività proteasi in modo localizzato spazialmente, noi e altri abbiamo sviluppato sonde FRET che si associano a componenti subcellulari tramite tagmolecolari 14,15,16,17,18,19. Tale strategia sintetica ha permesso lo sviluppo di NEmo-2 e mSAM, due sonde FRET dotate di ancoraggi lipidici che si localizzano nella membrana plasmatica. Questi giornalisti hanno alimentato una comprensione più profonda delle proteasi NE e CG nella fibrosi cistica e nelle malattie polmonari ostruzionistichecroniche 14,15.
Qui vengono forniti protocolli dettagliati per la visualizzazione e la quantificazione delle attività NE e CG solubili e legate a membrana nell'espettorato umano per mezzo della serie NEmo e SAM di sonde FRET. Per affrontare diversi aspetti della fisiopatologia degli NSP e fornire una serie di metodi che possono essere utilizzati in base alle esigenze specifiche dell'utente, viene mostrata l'analisi tramite spettroscopia a fluorescenza, microscopia a fluorescenza e citometria del flusso.
Protocol
I seguenti protocolli descrivono l'analisi eseguita sull'espettorato umano. La gestione dei campioni umani è stata approvata dal comitato etico dell'Università di Heidelberg e il consenso informato scritto è stato ottenuto da tutti i pazienti o dai loro genitori / tutori legali (S-370/2011) e controlli sani (S-046/2009).
NOTA: I seguenti protocolli descrivono la preparazione del campione e la quantificazione dell'attività delle proteasi della serina neutrofila (NSP). Le procedure sperimentali qui presentate si concentrano sulla misurazione dell'attività dell'espettorato umano e dell'elastasi neutrofila14,20,21 (NE) o catepsina G15 (CG). Tuttavia, lievi adattamenti nel protocollo di preparazione del campione rendono possibile l'analisi delle cellule derivate dal sangue e degli omogeneati tumorali. Inoltre, le attività della matrice metalloproteinasi 12 e della catepsina S possono essere studiate in modo simile mediante sonde FRETdedicate 22,23,24,25,26.
1. Preparazione del campione: isolamento cellulare e separazione supernatante
NOTA: Se possibile, il trattamento dell'espettorato deve essere effettuato entro 120 minuti dall'espettorazione e l'espettorato deve essere conservato sul ghiaccio fino a ulteriore lavorazione.
- Se l'espettorazione spontanea dell'espettorato non è possibile, indurre l'espettorato come descrittoin precedenza 19. In breve, inalare 200 μg del salbutamolo antagonista del recettore β-2 prima di iniziare la procedura di induzione dell'espettorato. Successivamente, inalare una soluzione salina ipertonica (6%) per 15 minuti utilizzando un nebulizzatore. Raccogliere l'espettorato espettorato in una piastra di Petri.
- Separare i grumi di muco dalla saliva in una piastra di Petri con l'aiuto di una punta di pipetta.
- Pesa il muco.
NOTA: Il peso medio di un campione di muco è di 0,8 g (variabile tra 0,1 g e 5 g); 0,1 g sono generalmente sufficienti per eseguire le procedure menzionate. - Aggiungere 4 parti (v/w) di Sputolysin al 10% (in PBS) all'espettorato (ad esempio: 4 mL di 10% di Sputolysin per ogni grammo di espettorato).
ATTENZIONE: La sputolisina è composta da ditiothiothreitol concentrato nel tampone fosfato, quindi maneggiarla con cura. - Incubare la miscela a temperatura ambiente (RT) su uno shaker a dondolo per 15 minuti per sciogliere il muco. Per motivi di sicurezza, posizionare lo shaker in una cappa aspirante.
- Temprare la reazione aggiungendo lo stesso volume di PBS freddo (ad esempio: 1 mL di PBS freddo per ogni mL di 10% Sputolysin).
- Mescolare con pipettazione per ottenere una soluzione omogenea.
- Filtrare la miscela attraverso un colino a celle di nylon da 100 μm in un tubo da 50 ml.
- Ripetere il passaggio di filtrazione attraverso un filtro a celle in nylon da 40 μm.
- Centrifugare la soluzione per 10 min a 300 x g a 4 °C.
- Trasferire accuratamente la frazione supernatante in un tubo fresco e conservarla sul ghiaccio.
NOTA: Le frazioni supernatanti possono essere conservate a -20 °C o -80 °C fino a ulteriori analisi. - Rimorsi delicatamente il pellet cellulare in 500 μL di PBS freddo e posizionarlo sul ghiaccio.
NOTA: La frazione cellulare deve essere elaborata immediatamente.
2. Misurazione dell'attività della proteasi della serina neutrofila
NOTA: Qui vengono introdotti diversi metodi per quantificare l'attività dei NSP tramite i reporter FRET. La scelta della tecnologia è dettata dalla specifica questione biomedica e dallo scopo dell'esperimento. Le sonde presentate sono state ampiamente testate per la loro specificità rispetto a una serie di enzimi rilevanti per ipolmoni 14,15. Sebbene le sonde siano specifiche verso il loro enzima bersaglio, controllare sempre la specificità della sonda sul campione clinico di interesse. Ciò può essere ottenuto incubando il campione con uno specifico inibitore della proteasi prima dell'aggiunta della sonda, che dovrebbe abolire qualsiasi aumento del rapporto D/A.
- Quantificazione dell'attività dei NSP solubili tramite saggio fluorimetro o lettore di lastre
NOTA: L'attività proteasi nelle frazioni solubili del campione può essere rilevata con qualsiasi strumento in grado di rilevare la fluorescenza.- Scongelare gli enzimi sul ghiaccio.
- Fino all'uso, conservare NE e CG in tampone di stoccaggio acido (acetato di sodio da 50 mM, NaCl da 200 mM, pH 5,5) per evitare l'autosa scissione.
- Per impostare una curva standard enzimatica, preparare una diluizione seriale 1:2 dell'enzima (33.9 - 0.271 nM per NE; 42.6 - 0.333 nM per CG) nel tampone di attivazione (10 mM Tris-HCl, 500 mM NaCl a pH 7.5). Il buffer di attivazione ha un pH neutro e quindi consente la catalisi enzimatica in modo efficiente.
- Per preparare la concentrazione standard più elevata (concentrazione di NE: 33,9 nM), diluire 1 μL di NE (33,9 μM) in 999 μL di tampone di attivazione.
- Per preparare il secondo standard (concentrazione NE: 16,95 nM), mescolare 200 μL della prima diluizione con 200 μL di tampone di attivazione.
- Procedere di conseguenza per preparare le restanti diluizioni 1:2.
- L'ultimo standard, che è lo spazio vuoto, è composto da un buffer di attivazione puro. Si raccomanda la misurazione di duplicati tecnici o triplicati. Durante la preparazione standard e del campione, cercare di mantenere le fiale sul ghiaccio.
- Parallelamente alla preparazione standard, diluire i campioni di espettorato nel buffer di attivazione. Diluire i campioni umani prima di valutare la loro attività proteasi per rimanere nella gamma lineare di aumento del segnale del reporter (rapporto donatore/accettore). Se i campioni del paziente non fossero diluiti, la scissione si verifica troppo rapidamente per un raccordo affidabile. Poiché l'espettorato del donatore sano contiene meno proteasi attive rispetto ai campioni di pazienti affetti da CF e BPCO, vengono generalmente eseguite diverse diluizioni (1:10 per il supernatante sano dell'espettorato, 1:20-500 per il supernatante di espettorato di pazienti affetti da BPCO o CF).
NOTA: Per misurare quantitativamente l'attività proteasi in campioni in cui la loro concentrazione è sconosciuta, è necessario misurare in parallelo una curva standard con concentrazioni enzimatiche note, idealmente sulla stessa piastra. La concentrazione di enzima attivo nell'espettorato umano viene calcolata interpolando i pendenze misurati nei campioni di espettorato umano con quelli misurati con le curve standard. - Prima di preparare i campioni per la misurazione, impostare lo strumento. Impostare la lunghezza d'onda di eccitazione per la sonda NE FRET (NEmo-114) su 354 nm e impostare la lunghezza d'onda di rilevamento su 400 nm per il donatore e 490 nm per l'accettore. Impostare la lunghezza d'onda di eccitazione per la sonda CG FRET (sSAM15) su 405 nm e impostare l'emissione su 485 (donatore) e 580 nm (accettore).
- Aggiungere 40 μL di campioni, standard o vuoti nei pozzali di una piastra nera a mezza area da 96 po'.
- Per preparare il master mix contenente i giornalisti (concentrazione del reporter nel master mix: 10 μM), diluire il materiale della sonda (1 mM in DMSO) 1:100 nel buffer di attivazione. Preparare il volume di mixaggio principale necessario moltiplicando 10 μL x il numero di pozzi di piastre richiesti. Per raggiungere la concentrazione finale ottimale (2 μM) per la misurazione della fluorescenza dei reporter NEmo-1 e sSAM, aggiungere 10 μL della miscela principale a ciascun pozzo (contenente 40 μL di entrambi i campioni, standard o vuoti) e iniziare la lettura. I reporter NEmo-1 e sSAM monitoreranno quindi l'attività solubile dell'elastasi neutrofila e della catepsina G, rispettivamente.
NOTA: Se un iniettore di reagente non è disponibile, assicurarsi di avviare la lettura il prima possibile dopo l'aggiunta del reporter ai campioni. - Avviare la misurazione del lettore di lastre e registrare il rapporto donatore/accettore aumentare ogni 60-90 secondi per almeno 20 minuti o fino a quando l'aumento del segnale raggiunge un plateau.
- Una volta esportati i dati, calcolare il rapporto donatore/accettore (rapporto D/A) dividendo le unità di fluorescenza relative del donatore (RFU) con l'accettore RFU per ogni punto di tempo e campione.
- Calcolare la media del rapporto D/A e la deviazione standard di ciascun campione.
- Determinare la pendenza all'interno della crescita lineare della variazione del rapporto D/A. La pendenza è un indicatore della velocità di scissione enzimatica per una sonda FRET. Calcolare la concentrazione di enzima attivo nell'espettorato adattando i pendenze di regressione lineare derivati dai campioni umani con quelli calcolati dallo standard enzimatico.
- Quantificazione dell'attività degli NSP legati a membrana tramite saggio fluorimetro o lettore di piastre
- Isolare le cellule dell'espettorato come descritto in precedenza. Resuspend 3 x 104 cellule in un volume di 40 μL di PBS. Aggiungere bene le celle al lettore di lastre.
- Impostare lo strumento. Impostare la lunghezza d'onda di eccitazione per la sonda NE FRET legata alla membrana (NEmo-214) su 405 nm e impostare la lunghezza d'onda di rilevamento su 485 nm per il donatore e 580 nm per l'accettore. Impostare la lunghezza d'onda di eccitazione per la sonda CG FRET legata alla membrana (mSAM15) su 405 nm e impostare l'emissione su 485 (donatore) e 580 nm (accettore).
- Per preparare il mix master contenente i reporter, diluire il materiale della sonda nel buffer di attivazione a una concentrazione di 10 μM. Preparare il volume di mix master necessario moltiplicando 10 μL X il numero di pozzi di piastra richiesti. Per raggiungere la concentrazione finale ottimale (2 μM) per la misurazione della fluorescenza dei reporter NEmo-2 e mSAM, aggiungere 10 μL della miscela principale a ciascun pozzo (contenente 40 μL di entrambi i campioni, standard o vuoti) e iniziare la lettura. I reporter NEmo-2 e mSAM monitoreranno quindi l'attività neutrofila elastasi e catapsina G legata alla membrana, rispettivamente.
NOTA: È possibile utilizzare un controllo negativo cellulare, ad esempio cellule che non secernono attivamente i PNE. Ad esempio, l'incubazione dei reporter con 3 x 104 progenitori di leucociti HL-60 cellule promielocitiche rappresenta un valido controllo negativo della scissione. - Variazione record del rapporto donatore/accettore per almeno 20 minuti o fino a quando l'aumento del segnale raggiunge un plateau. Analizzare i dati come descritto sopra.
- Misurazione dell'attività degli NSP legati alla membrana tramite microscopia a fluorescenza
- Determinare il numero di condizioni che devono essere analizzate.
NOTA: Per ogni misurazione del campione di espettorato, si raccomanda la preparazione e l'analisi di un ulteriore controllo positivo (PC) e negativo (NC). - Per ogni misurazione, resuspend 3 x 104 celle di espettorato in un volume di 50 μL PBS in un tubo da 1,5 ml.
- Come controllo negativo, incubare le cellule dell'espettorato con uno specifico inibitore (Sivelestat, inibitore specifico della NE, o inibitore della catepsina G I, inibitore specifico del CG, ad una concentrazione finale di 100 μM). Incubare per 10 minuti a RT.
- Come controllo positivo, incubare le cellule dell'espettorato con l'enzima appropriato (NE o CG rispettivamente a 340 nM o 200 nM) per 10 minuti a RT.
- Aggiungere 50 μL di PBS contenente il reporter FRET e una macchia nucleare (in una diluizione finale 1:1000) a ciascun tubo (cellule positive trattate con controllo, cellule trattate con controllo negativo e cellule non trattate) al fine di raggiungere una concentrazione finale della sonda di 2 μM. Incubare per 10-20 min a RT.
IMPORTANTE: L'aggiunta di una macchia nucleare facilita l'imaging della microscopia a fluorescenza in quanto consente di cercare cellule di interesse dell'espettorato senza utilizzare i canali della sonda FRET e quindi di evitare lo sbiancamento del reporter. Inoltre, la macchia di DNA consente di segmentare le cellule dell'espettorato in base alla forma del loro nucleo. Ad esempio, i neutrofili possono essere facilmente identificati dai loro nuclei multilobulari. Inoltre, è possibile recuperare ulteriori informazioni sulla vitalità delle cellule (i neutrofili con un nucleo più segmentato hanno maggiori probabilità di essere vivi).
NOTA: Oltre a quella legata alla membrana, l'attività di NE o CG legato al DNA nell'espettorato umano può essere misurata allo stesso modo per mezzo di H-NE e H-CG, sonde FRET extracellulari che associano il DNA27. Durante la preparazione della miscela master, H-NE e H-CG possono essere aggiunti alla concentrazione di 10 μM e incubati con espettorato prima della preparazione di citospini e scivolo. La quantificazione del rapporto D/A sul DNA extracellulare procede in modo identico a NEmo-2 e mSAM, con l'unica differenza che gli aggregati di DNA extracellulare sono segmentati invece di singole cellule27. - Dissetare la reazione aggiungendo 100 μL di PBS ghiacciato e trasferire campioni sul ghiaccio.
- Citospin la miscela su vetrini di microscopia, asciugare all'aria, fissare con metanolo ghiacciato 10% per 10 min, asciugare all'aria e montare con un mezzo di montaggio appropriato.
NOTA: Le diapositive di microscopia possono essere conservate a 4 °C al buio per un massimo di un mese fino a ulteriori analisi. - Acquisire immagini di microscopia utilizzando un microscopio confocale con un obiettivo di olio PL APO 40x o 63x. Per aumentare la qualità dell'immagine e ridurre i tempi di acquisizione è consigliata una modalità sequenziale di acquisizione delle immagini.
- Immagina la macchia nucleare prima tramite eccitazione a 633 nm con la linea elio-neon-laser e registra la sua emissione tra 650 e 715 nm.
- Registrare il donatore (cumarina 343) del reporter FRET tra 470 e 510 nm all'eccitazione a 458 nm con un laser argon. Acquisire l'emissione di accettore sensibilizzato (5,6-TAMRA) tra 570 e 610 nm dopo l'eccitazione dell'unico donatore.
- Registrare l'emissione di accettore diretto in un canale separato tra 470 e 510 nm su un'eccitazione ottimale dell'accettore a 561 nm utilizzando il laser APSS (Pumped Solid State) del diodo.
- Impostare il foro stenopeico all'inizio dell'esperimento e mantenerlo durante il corso della sessione di imaging.
NOTA: A causa delle loro piccole dimensioni, si consiglia l'uso di un obiettivo di microscopio 40x o 63x per visualizzare correttamente i neutrofili. Di solito, le immagini vengono acquisite in diversi canali consecutivi, a partire dalla lunghezza d'onda di eccitazione più lunga per prevenire il fotobleaching del reporter durante l'acquisizione.
- Immagine di almeno 100 celle per condizione per statistiche conclusive. Per l'analisi delle immagini al microscopio utilizzare un software appropriato: segmentare le celle e calcolare il rapporto D/A in base al pixel, in seguito calcolare la media o mediana di una data regione di interesse che viene selezionata manualmente dall'utente. Per i risultati rappresentativi si veda la figura 1.
- Determinare il numero di condizioni che devono essere analizzate.
Figura 1: Immagini rappresentative e quantificazione dell'attività NE legata alla membrana sui neutrofili isolati dall'espettorato del paziente CF. a) Immagini rappresentative di microscopia confocale di neutrofili pre-incubati (pannello superiore) per 10 min con 100 μM di Sivelestat (w/) o lasciati non trattati (w/o) (pannello inferiore) prima dell'aggiunta del reporter NEmo-2 (2 μM). La prima colonna da sinistra mostra la macchia nucleare, la seconda il canale donatore, la terza il canale accettore e l'ultima il rapporto D/A calcolato ottenuto dividendo i canali donatore e accettore su base pixel per pixel. I confini della regione di interesse (singolo neutrofilo) sono raffigurati come linee tratteggiate. Sono indicate le barre di scala (10 μm) e di taratura (rapporto D/A). b)Box- e dot-plot che mostrano il rapporto D/A dei neutrofili dell'espettorato di un paziente CF rappresentativo. Le cellule incubate con cellule inibitorie e non trattate sono mostrate rispettivamente in grigio e blu. Ogni punto rappresenta una cellula (N: w/ inibitore = 113 e w/o inibitore = 96). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
- Misurazione dell'attività degli NSP legati alla membrana tramite citometria del flusso
- Resuspend 1 x 106 celle in 100 μL di PBS in un tubo di polistirolo facs da 5 ml e posizionare il tubo sul ghiaccio.
- Per gateare i neutrofili dell'espettorato, utilizzare i seguenti anticorpi: CD14 (1:50), CD16 (1:50), CD45 (1:33) e CD66b (1:50). Preparare un mix master sufficiente per tutti i campioni. Metti il mix maestro sul ghiaccio al buio.
- Impostare la strategia di gating come descritto nella figura 2. I neutrofili sono gated come 7AAD-CD45+CD14-CD16+CD66b+ eventi. Gli eventi gated verranno quindi analizzati per la loro attività proteasi legata alla membrana per il loro donatore (λexc = 405 nm, λem = 450/50 nm) e accettore (λexc = 405 nm, λem = 585/42 nm) intensità fluorescenti medie (IFM).
- Aggiungere 2 μL di FcBlock a ciascun campione e incubare per 5 minuti a RT.
- Aggiungere gli anticorpi scelti a ciascun tubo e incubare per 30 minuti sul ghiaccio al buio.
- Lavare le celle aggiungendo 2 mL di PBS freddo e centrifugare per 5 minuti a 300 x g e 4 °C. Scartare le cellule supernatanti e resuspend in 200 μL di PBS freddo.
- Dividere i 200 μL in due tubi con 100 μL ciascuno e aggiungere 5 μL di soluzione di colorazione di vitalità cellulare in ciascun tubo. Metti i tubi sul ghiaccio.
- Aggiungere un inibitore specifico NSP appropriato (per NE utilizzare Sivelestat a concentrazione finale di 225 μM, per CG utilizzare catepsina G Inibitore I a 100 μM) alla provetta di controllo negativo (NC). Incubare i campioni a RT per 10 minuti al buio.
- Aggiungere 100 μL di PBS freddo al campione, filtrarlo attraverso un filtro da 40 μm in un tubo FACS pulito per evitare l'intasamento dello strumento.
- Aggiungere il reporter (per NE, NEmo-2 ad una concentrazione finale di 4 μM, per CG, mSAM ad una concentrazione finale di 2 μM) al campione NC, vortice delicatamente il tubo.
- Inizia ad acquisire cellule incubate con l'inibitore specifico per regolare leggermente, se necessario, i cancelli e le tensioni dei PMT del reporter.
- Registrare almeno 1000 neutrofili. Conservare il campione a temperatura ambiente.
NOTA: Sebbene sia possibile registrare più eventi, 1000 celle garantiscono un buon compromesso tra statistiche corrette e tempo di registrazione. - Procedere di conseguenza con i seguenti tubi (campioni di espettorato non trattati).
- Per registrare le variazioni del rapporto D/A dovute all'attività proteasi legata alla membrana, registrare 1000 neutrofili da ogni tubo ogni 5-10 minuti.
NOTA: Dopo aver superato con successo la scissione del reporter FRET, l'intensità delle IFM del canale donatore aumenterà nel tempo. L'intensità delle IFM del canale accettore dovrebbe diminuire o rimanere costante nel tempo. - Calcola il rapporto FRET dividendo il donatore per i valori del canale accettore per i campioni misurati sui singoli neutrofili vitali gated.
- Normalizzare le misurazioni del campione dividendoli con il corrispondente punto di tempo di 0 minuti (per risultati rappresentativi e analisi cfr. figura 2).
NOTA: La registrazione di almeno due punti di tempo (cioè 0 e 10 min) è necessaria per una misurazione dinamica della variazione del rapporto D/A. Per normalizzare la misurazione dell'attività per ciascun campione, il rapporto D/A misurato in punti di tempo successivi (ad esempio, 10 min) è diviso per il rapporto calcolato immediatamente dopo l'aggiunta della sonda (0 min).
Figura 2: Strategia di Gating e grafici rappresentativi dell'attività NE legata alla membrana misurati sui neutrofili isolati dall'espettorato del paziente CF. a)Per gateare i neutrofili dell'espettorato vengono utilizzati i seguenti anticorpi: CD14 (1:50), CD16 (1:50), CD45 (1:33) e CD66b (1:50). I neutrofili sono gated come 7-AAD-CD45+CD14-CD16+CD66b+ eventi. Gli eventi gated vengono analizzati per il loro donatore (λexc= 405 nm, λem= 450/50 nm) e accettore (λexc= 405 nm, λem= 585/42 nm) intensità medie di fluorescenza (IFM). b)Istogrammi rappresentativi dei neutrofili cf dell'espettorato analizzati per la loro attività NE legata alla membrana. La colonna sinistra mostra il segnale del donatore, la colonna destra mostra il segnale accettore. La riga superiore mostra intensità di fluorescenza media delle cellule trattate con Sivelestat (w/) per 10 minuti prima dell'aggiunta del reporter. La riga inferiore mostra cellule non trattate (w/o) la cui fluorescenza reporter viene misurata immediatamente (0 min, grigio) e 10 min (blu) dopo l'aggiunta del reporter. I neutrofili sono gated secondo la strategia mostrata nel pannello a. c) La tabella dati mostra un set di dati rappresentativo costituito da IFM grezze per il donatore e segnale accettore sui neutrofili misurati su diversi punti di tempo (0-3-5-10-15-20 min) e il rapporto D/A calcolato. Il rapporto D/A può essere normalizzato, cioè al punto di tempo di 0 minuti (carattere bianco). 0 min indica una registrazione eseguita il prima possibile dopo l'aggiunta del reporter al tubo di flusso con celle di espettorato macchiate. I dati delle IFM sono mostrati come ± deviazione standard per 1000 neutrofili. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Representative Results
I risultati riportati nella figura 1a illustrano un set di dati rappresentativo per microscopia. Il segnale nucleare è usato per identificare i neutrofili dai loro caratteristici nuclei segmentati. L'area di interesse (ROI) viene selezionata manualmente (linea tratteggiata nella figura 1a). L'immagine del rapporto D/A viene calcolata dividendo le intensità del canale donatore per le intensità del canale accettore in base al pixel. Nell'ultimo passaggio viene calcolato il rapporto medio D/A per cella (ROI). Nella figura 1b ogni punto rappresenta la media di un ROI (neutrofilo). Si consiglia di immagini e valutare circa 100 celle per condizione.
Una strategia rappresentativa di gating della citometria del flusso è illustrata nella figura 2a. Tale gating consente di discriminare e studiare i neutrofili dell'espettorato. Per evitare fuoriuscite di fluorescenza o artefatti di compensazione, si consiglia di dedicare una linea laser (ad esempio, laser blu) al rilevamento della fluorescenza della sonda FRET. La compensazione della fluorescenza della citometria a flusso deve essere eseguita per gli anticorpi e non per la sonda FRET. La figura 2b descrive la distribuzione delle IFM a 0 e 10 minuti dopo l'aggiunta del reporter. Ogni riga della figura 2c indica i valori medi di NMI donatori e accettori per 1000 neutrofili dell'espettorato. Il rapporto D/A viene calcolato dividendo le IFM del donatore e dell'accettore. Il corso di tempo nella figura 2c sul lato destro mostra la progressione della misurazione: dopo un rapido aumento iniziale, il rapporto D/A raggiunge un plateau, in base all'attività dell'enzima legato alla membrana.
Discussion
I protocolli riportati spiegano diversi approcci per quantificare l'attività dell'elastasi neutrofila e della catepsina G nei campioni di espettorato umano. I punti critici per una misurazione efficace dell'attività enzimatica sono i) tempi precisi e standardizzazione della procedura operativa e ii) l'uso di controlli negativi e positivi affidabili. Se queste condizioni sono soddisfatte, i metodi descritti non si limitano all'espettorato, ma possono anche essere facilmente adattati all'analisi dell'attività proteasi nel sangue, nei fluidi di lavanda broncoalveolare e nelle sezioni tissutali o negli omogeneati.
Ognuna delle tre tecniche ha i suoi punti di forza e limiti, che spesso si completano a vicenda. Ad esempio, la citometria del flusso consente l'analisi rapida delle popolazioni cellulari rare e la fenotipizzazione cellulare, ma manca di informazioni sulla risoluzione spaziale, che possono essere ottenute tramite microscopia. Invece, le misurazioni del lettore di lastre consentono la valutazione parallela di diversi campioni o condizioni in modo ad alta produttività. Poiché le cellule fresche dell'espettorato non possono essere congelate e immagazzinate, i tre metodi richiedono che i campioni debbano essere elaborati rapidamente dopo l'espettorazione. Ciò limita la flessibilità o la velocità effettiva delle misurazioni dell'attività legata alla membrana. Lo sviluppo di un protocollo di citometria a flusso che consente di fissare le cellule dopo l'aggiunta della sonda e la scissione enzimatica si aprirebbe alla misurazione parallela di un numero maggiore di tubi. Inoltre, occorre prestare particolare attenzione alla movimentazione e allo stoccaggio delle sonde FRET. Infatti, alcuni amminoacidi presenti nel substrato peptidico, come la metinina, subiscono ossidazione che porta a una diminuzione della sensibilità del reporter. Per aumentare la durata di conservazione del reporter (stimato in circa tre mesi a 20 °C), possono essere conservati in aliquote di piccolo volume (1-2 μL) sotto gas inerte come azoto o argon.
In CF e altre malattie polmonari infiammatorie croniche è importante rilevare l'infiammazione il prima possibile e biomarcatori affidabili hanno il potenziale per raggiungere tale obiettivo. La possibilità di rilevare l'attività degli NSP legati alla superficie, che si è dimostrata dannosa per il tessuto circostante, anche in condizioni in cui non vi è alcuna o poca attività ne libera, aggiunge un altro livello di informazioni preziose, che difficilmente può essere raggiunto con altri metodiesistenti 4,11.
I giornalisti possono essere utilizzati per studiare il legame dell'attività NSP associata legata alla membrana con la gravità e la progressione della malattia polmonare, specialmente alla sua esordio precoce. I metodi possono essere utilizzati per monitorare l'efficacia del trattamento (ad esempio, trattamenti antinfiammatori o modulatori CFTR altamente efficaci e potenziatori28) e indagare il conseguente smorzamento dell'infiammazione guidata da neutrofili. Inoltre, i protocolli si basano su procedure campionazionali non invasive che comportano un rischio molto basso per il paziente e, pertanto, possono essere utilizzati su scala molto ampia e aprire le porte a numerose applicazioni entusiasmanti.
Disclosures
Gli autori non dichiarano alcun conflitto di interessi.
Acknowledgments
Questo progetto è stato sostenuto da sovvenzioni del Ministero tedesco dell'Istruzione e della Ricerca (FKZ 82DZL004A1 a M.A.M) e della Fondazione tedesca per la ricerca (SFB-TR84TP B08-M.A.M). Il lavoro descritto in questo manoscritto è stato supportato dal Centro tedesco di ricerca polmonare (DZL) e dall'EMBL Heidelberg attraverso una borsa di dottorato per M.G. Ringraziamo J. Schatterny, S. Butz e H. Scheuermann per l'assistenza tecnica esperta.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 100 µm Nylon cell strainer | Corning Inc. | 431752 | |
| 2300 EnSpire (Multilabel Plate Reader) | PerkinElmer | ||
| 35x10mm Dish, Nunclon Delta | Thermo Fisher Scientific | 150318 | |
| 40 µm Nylon cell strainer | Corning Inc. | 431750 | |
| 50 mL tubes | Sarstedt | 10535253 | |
| 7-AAD, viability dye | Bio Legend | 420404 | 5 µL/100 µL |
| Balance | OHAUS Instruments (Shanghai) Co., Ltd. | PR124 | |
| BD Falcon Round-Bottom Tubes 5 mL | BD Bioscience | 352054 | |
| BD LSRFortessa cell analyzer | BD Bioscience | ||
| black flat bottom 96 well half area plate | Corning Life Science | 3694 | |
| Cathepsin G | Elastin Products Company | SG623 | |
| Cathepsin G Inhibitor I | Merck KGaA | 219372 | |
| Centrifuge 5418R | Eppendorf AG | EP5401000137 | |
| Combitips advanced 1.0 mL | Eppendorf AG | 0030 089 430 | |
| cOmplete proteinase inhibitor | Roche | 11697498001 | |
| Countig chambers improved Neubauer | Glaswarenfabrik Karl Hecht GmbH & Co KG | 40442 | |
| coverslips Ø 25mm | Thermo Fisher Scientific | MENZCB00250RA003 | |
| Cytospin 4 | Thermo Fisher Scientific | ||
| DRAQ5 (nuclear stain) | BioStatus Limited | DR50050 | 1:10000 |
| FACSDiva software, v8.0.1 | BD Bioscience | ||
| FcBlock | BD Bioscience | 564219 | |
| Fiji (Fiji Is Just ImageJ) | fiji.sc | ||
| Flow Jo software, v10 | TreeStar | ||
| FluoQ Plugin, v3-97 | |||
| Heraeus Megafuge 16R | Thermo Fisher Scientific | ||
| Human Sputum Leucocyte Elastase | Elastin Products Company | SE563 | |
| Leica SP8 confocal microscope | Leica Microsystems | ||
| Mini Rock-Shaker | PEQLAB Biotechnologie GmbH | MR-1 | |
| mouse anti-human CD14, Pe-Cy7, clone M5E2 | BD Bioscience | 557742 Lot:8221983 | 1:50 |
| mouse anti-human CD16, AF700, clone 3G8 | BD Bioscience | 557820 Lot:8208791 | 1:50 |
| mouse anti-human CD45, APC-Cy7, clone 2D1 | BD Bioscience | 557833 Lot:8059688 | 1:33 |
| mouse anti-human CD66b, PE/Dazzel 594, clone G10F5 | BioLegend | 305122 Lot:B241921 | 1:50 |
| mSAM | in house | 2 mM | |
| Multipette plus | Eppendorf AG | ||
| NEmo-1 | SiChem | SC-0200 | 1 mM |
| NEmo-2E | SiChem | SC-0201 | 2 mM |
| Pari Boy SX with an LC Sprint jet nebulizer | Pari | 085G3001 | |
| phosphate buffered saline | Gibco | 10010-015 | |
| ROTI Histokitt (mounting medium) | Carl Roth GmbH + Co.KG | 6638.1 | |
| Salbutamol | Teva GmbH | ||
| Sivelestat | Cayman Chemicals | 17779 | |
| Sputolysin | Calbiochem | 560000-1SET | |
| sSAM | in house | 2 mM | |
| SuperFrost Plus Adhesion slides | Thermo Fisher Scientific | 10149870 | |
| Trypan Blue solution | Sigma-Aldrich | T8154 |
References
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