Бурая жировая ткань (BAT) представляет собой жировое депо, специализирующееся на рассеивании энергии, которое также может служить эндокринным органом посредством секреции биологически активных молекул. Создание BAT-специфических нокаут-мышей является одним из самых популярных подходов к пониманию вклада интересующего гена в BAT-опосредованную регуляцию энергии. Традиционная стратегия нацеливания на гены с использованием системы Cre-LoxP была основным подходом к созданию ткано-специфических нокаутных мышей. Однако такой подход отнимает много времени и утомителен. Здесь мы описываем протокол быстрого и эффективного нокаута интересующего гена в BAT с использованием комбинированной системы однонаправляющей РНК (sgRNA) Cre-LoxP, CRISPR-Cas9 и аденоассоциированного вируса (AAV). Межлопаточная БАТ расположена в глубоком слое между мышцами. Таким образом, BAT должен быть выставлен, чтобы точно и непосредственно вводить AAV в BAT в поле зрения. Надлежащая хирургическая обработка имеет решающее значение для предотвращения повреждения симпатических нервов и сосудов, таких как вена Зульцера, которая соединяется с БАТ. Чтобы свести к минимуму повреждение тканей, существует острая необходимость в понимании трехмерного анатомического расположения НДТ и хирургических навыков, необходимых на технических этапах. В этом протоколе освещаются ключевые технические процедуры, включая разработку сгРНК, нацеленных на интересующий ген, подготовку частиц AAV-sgRNA и операцию по прямой микроинъекции AAV в обе доли BAT для получения BAT-специфических нокаутных мышей, которые могут быть широко применены для изучения биологических функций генов в BAT.