Transparente sebrafisk embryoer har vist seg nyttige modell verter å visualisere og funksjonelt studere samspillet mellom medfødte immunceller og intracellulære bakterier, for eksempel<em> Salmonella typhimurium</em> Og<em> Mycobacterium marinum</em>. Micro-injeksjon av bakterier og multi-color fluorescens bildebehandling er viktige teknikker involvert i anvendelsen av sebrafisk embryo infeksjon modeller.