Total cellulær RNA gir et dårlig mal for å studere kortvarige endringer i RNA-syntese og nedbrytning, så vel som kinetikken til RNA prosessering. Her beskriver vi metabolsk merking av nylig transkriberte RNA med 4-thiouridine etterfulgt av tiol-spesifikk biotinylering og rensing av nylig transkriberte RNA tillater å overvinne disse begrensningene.