यह पत्र सॉफ़्टवेयर सुइट स्पीयर द्वारा क्रियो-ईएम छवियों को प्रसंस्करण के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करता है। वर्तमान प्रोटोकॉल लगभग सभी एकल कण ईएम परियोजनाओं के लिए लागू किया जा सकता है जो निकट-परमाणु संकल्प को लक्षित करते हैं।