Journal
/
Genetics
/
Transcriptomic ניתוח<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA רצף נתונים באמצעות Suite טוקסידו על פרויקט גלקסי
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Transcriptomic ניתוח<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA רצף נתונים באמצעות Suite טוקסידו על פרויקט גלקסי

DOI:
10.3791/55473-v

•

10:19 min

•

April 08, 2017

•

,
1Department of Pediatrics,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:56Getting Started with Galaxy
  • 03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
  • 06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
  • 07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
  • 09:39Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

גלקסי והדוד צמחו ככלים פופולריים המאפשרים לחוקרים ללא הכשרה ביואינפורמטיקה לנתח ולפרש נתוני RNA-seq. אנו מתארים פרוטוקול לחוקרי אלגנס לבצע ניסויים-Seq RNA, גישה ולעבד את הנתונים באמצעות גלקסי ולקבל מידע ביולוגי משמעותי מרשימות הגן באמצעות DAVID.

Tags

C. ElegansRNA SequencingTranscriptomic AnalysisTuxedo SuiteGalaxy ProjectBioinformaticsDifferential Gene ExpressionGene OntologyNGS RNA AnalysisFASTQData UploadWorkflow

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Optogenetic mutagenesis אקראי באמצעות היסטון-miniSOG ב<em> C. elegans</em

מבחני מזווג Conjugative עבור ניתוח רצף ספציפי של חלבוני העברה מעורבים קוניוגציה

איתור של שינוי מספר העתקה באמצעות רצף תא יחיד

ביטוי ערוץ יון לשליטה באמצעות Transfection ועין מתנהל חלוף

ניתוח של C-KIT ליגנד האמרגן באמצעות Immunoprecipitation הכרומטין

מניפולציה של פלואידיות ב Caenorhabditis elegans

Informatic ניתוח של נתוני רצף אצווה שמרים 2-היברידית המסכים

תא בודד RNA רצף וניתוח של איי הלבלב האנושי

זיהוי של טביעות רגליים של RNA: מכלולי חלבון באמצעות RNA Immunoprecipitation בטנדם ואחריו רצף (RIPiT-Seq)

זיהוי של RNAs מעגלית באמצעות רצפי RNA

Read Article