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Transkriptom-Analyse von<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequenzierung Daten durch die Tuxedo Suite auf dem Galaxy-Projekt
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Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
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Transkriptom-Analyse von<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequenzierung Daten durch die Tuxedo Suite auf dem Galaxy-Projekt

DOI:
10.3791/55473-v

•

10:19 min

•

April 08, 2017

•

,
1Department of Pediatrics,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:56Getting Started with Galaxy
  • 03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
  • 06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
  • 07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
  • 09:39Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Galaxy und DAVID haben als beliebte Werkzeuge entstanden, die Ermittler ohne Bioinformatik Ausbildung ermöglichen RNA-Seq Daten zu analysieren und zu interpretieren. Wir beschreiben ein Protokoll für C. elegans Forscher RNA-Seq Versuche, den Zugang und verarbeiten die Daten - Set mit Galaxy und erhalten aussagekräftige biologische Informationen aus den Gen - Listen mit DAVID auszuführen.

Tags

Keywords: C. ElegansRNA SequencingTranscriptomic AnalysisTuxedo SuiteGalaxy ProjectBioinformaticsDifferential Gene ExpressionGene OntologyNGS RNA AnalysisFASTQData UploadWorkflow

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