Journal
/
Genetics
/
Транскриптомный Анализ<em> C</em>.<em> Элеганс</em> РНК Секвенирование данных через Tuxedo люкс по проекту Galaxy
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Транскриптомный Анализ<em> C</em>.<em> Элеганс</em> РНК Секвенирование данных через Tuxedo люкс по проекту Galaxy

DOI:
10.3791/55473-v

•

10:19 min

•

April 08, 2017

•

,
1Department of Pediatrics,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:56Getting Started with Galaxy
  • 03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
  • 06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
  • 07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
  • 09:39Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Galaxy и DAVID появились в качестве популярных инструментов, которые позволяют следователям без подготовки биоинформатики для анализа и интерпретации РНК-Seq данных. Мы опишем протокол для C. Элеганс исследователей проводить РНК-Seq экспериментов, доступ и обрабатывать набор данных с помощью Galaxy и получить значимую биологическую информацию из списков генов с использованием DAVID.

Tags

C. ElegansRNA SequencingTranscriptomic AnalysisTuxedo SuiteGalaxy ProjectBioinformaticsDifferential Gene ExpressionGene OntologyNGS RNA AnalysisFASTQData UploadWorkflow

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Оптогенетика Случайные мутагенеза Использование гистона-miniSOG в<em> C. Элеганс</em

Конъюгативных Спаривание Анализы для последовательности конкретного анализа переноса белков, участвующих в конъюгации бактерий

Обнаружение Copy Number Изменений Использование Single Cell Секвенирование

Управляемая Expression ионного канала через Индуцибельные временная трансфекция

Анализ промотора c-KIT-лиганда с использованием иммунопреципитации хроматина

Манипуляция плоидности в Caenorhabditis elegans

Информатики анализ последовательности данных из пакетного дрожжи 2-гибрид экраны

Одноклеточная РНК секвенирование и анализ островков поджелудочной железы человека

Идентификация следов РНК:Белковые комплексы через РНК иммунопреципиция в Тандеме После секвенирования (RIPiT-Seq)

Идентификация циркулярных РНК с использованием секвенирования РНК

Read Article