Journal
/
/
Analyse av Transcriptomic<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA sekvenseringsdata Gjennom Tuxedo Suite på Galaxy-prosjektet
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
DOI:

10:19 min

April 08, 2017

,

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:56Getting Started with Galaxy
  • 03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
  • 06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
  • 07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
  • 09:39Conclusion

Summary

Automatic Translation

Galaxy og David har dukket opp som populære verktøy som lar etterforskerne uten bioinformatikk trening for å analysere og tolke RNA-Seq data. Vi beskriver en protokoll for C. elegans forskere å utføre RNA-Seq eksperimenter, åpne og behandle datasettet ved hjelp av Galaxy og oppnå meningsfull biologisk informasjon fra gense listene ved hjelp av DAVID.

Related Videos

Read Article