Journal
/
/
Transcriptomic Analys av<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequencing data via Tuxedo Suite på Galaxy Project
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
DOI:

10:19 min

April 08, 2017

,

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:56Getting Started with Galaxy
  • 03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
  • 06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
  • 07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
  • 09:39Conclusion

Summary

Automatic Translation

Galaxy och David har dykt upp som populära verktyg som gör att utredarna utan bioinformatik utbildning för att analysera och tolka RNA-Seq data. Vi beskriver ett protokoll för C. elegans forskare att utföra RNA-Seq experiment, tillgång och bearbeta dataset med användning Galaxy och erhålla meningsfull biologisk information från genen listor med DAVID.

Related Videos

Read Article