Her præsenterer vi en mikroskopi-baseret protokol for høj opløsning imaging og en tre-dimensionel rekonstruktion af musen neurovaskulære enhed og blod - hjerne barrieren ved hjælp af hjernen frit svævende sektioner. Denne metode giver mulighed for visualisering, analyse og kvantificering af intracellulære organeller på BBB.