At undersøge flere, kan endogene posttranslationelle modifikationer for en target protein være ekstremt udfordrende. Teknikker beskrevet her udnytte en optimeret lysis buffer og filter system udviklet med specifikke PTM målretning, affinitet matricer til at registrere acetylation, ubiquitination, SUMOylation 2/3 og tyrosin fosforylering ændringerne for et mål protein ved hjælp af et enkelt, strømlinet system.