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从土壤、根际和根 Endosphere 提取细菌群落数据的根菌群探析

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Genetics

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Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere

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从土壤、根际和根 Endosphere 提取细菌群落数据的根菌群探析

DOI:

10.3791/57561-v

•

09:55 min

•

May 02, 2018

•

Tuesday Simmons, Daniel F. Caddell, Siwen Deng, Devin Coleman-Derr²

¹Department of Plant and Microbial Biology,University of California, Berkeley, ²Plant Gene Expression Center,USDA ARS

Chapters

00:05Title
00:46Collection and Separation of Root Endosphere, Rhizosphere, and Soil Samples
02:47DNA Extraction
04:11Amplicon Library Preparation and Submission
08:21Results: Effective DNA Amplification
09:10Conclusion

Summary

Automatic Translation

在这里, 我们描述了获取土壤、根际和根 endosphere 微生物的扩增子序列数据的协议。该信息可用于研究植物相关微生物群落的组成和多样性, 适合广泛的植物种类使用。

Tags

Keywords: Root Microbiome Soil Rhizosphere Root Endosphere 16S Ribosomal RNA Gene Community Profiling Microbial Ecology DNA Extraction Sequencing Library Soil Core Rhizosphere Separation Root Washing DNA Extraction

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