Journal
/
Genetics
/
Utforske rot Microbiome: utpakking bakterielle samfunnet Data fra jord, Rhizosphere og rot Endosphere
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere

Utforske rot Microbiome: utpakking bakterielle samfunnet Data fra jord, Rhizosphere og rot Endosphere

DOI:
10.3791/57561-v

•

09:55 min

•

May 02, 2018

•

, , ,
1Department of Plant and Microbial Biology,University of California, Berkeley, 2Plant Gene Expression Center,USDA ARS

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:46Collection and Separation of Root Endosphere, Rhizosphere, and Soil Samples
  • 02:47DNA Extraction
  • 04:11Amplicon Library Preparation and Submission
  • 08:21Results: Effective DNA Amplification
  • 09:10Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Her beskriver vi en protokoll for å få amplicon sekvens databehandling jord, rhizosphere og rot endosphere microbiomes. Denne informasjonen kan brukes til å undersøke komposisjon og mangfoldet av plante-assosiert mikrobielle samfunn, og er egnet for bruk med en rekke forskjellige plantearter.

Tags

Root MicrobiomeSoilRhizosphereRoot Endosphere16S Ribosomal RNA GeneCommunity ProfilingMicrobial EcologyDNA ExtractionSequencing LibrarySoil CoreRhizosphere SeparationRoot WashingDNA Extraction

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Konjugerbare Mating Analyser for sekvens-spesifikk analyse av Transfer proteiner involvert i Konjugasjon

Analyse av Transcriptomic<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA sekvenseringsdata Gjennom Tuxedo Suite på Galaxy-prosjektet

Toveis retroviral integrasjonssted PCR-metodikk og kvantitativ dataanalyse arbeidsflyt

Bestemmelse av den optimale Chromosomal plassering(er) gir et DNA i Escherichia coli bruker en ny Transposon-mediert tilnærming

Eksempel forberedelse og analyse av RNASeq-baserte genuttrykk Data fra sebrafisk

Informatic analyse av sekvens Data fra satsvis gjær 2-Hybrid-skjermer

Utforske romfart effekter på musen fysiologi ved hjelp av Open Access NASA GeneLab plattformen

Isolere, sekvensering og analysere ekstracellulære MicroRNAs fra menneskelige stamceller

Bruke i Vitro og i celle form å undersøke små molekyl indusert Pre-mRNA strukturelle endringer

Tomatrottransformasjon etterfulgt av inokulasjon med Ralstonia Solanacearum for enkel genetisk analyse av bakteriell wiltsykdom

Read Article