A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Title
- 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
- 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
- 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
- 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
- 08:29Conclusion
Identifikation af fysiske interaktion mellem gener og regulerende elementer er udfordrende men er blevet fremmet af kromosom kropsbygning fange metoder. Denne ændring i 4C-seq protokollen afbøder PCR bias ved at minimere overdreven forstærkning af PCR skabeloner og maksimerer mappability af læser ved at indarbejde en tilføjelse begrænsning enzym digest trin.
