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Hochdurchsatz-Identifizierung des Gens regulatorischen Sequenzen mit Next-Generation Sequenzierung der kreisförmigen Chromosom Konformation erfassen (4C-Seq)
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
High-throughput Identification of Gene Regulatory Sequences Using Next-generation Sequencing of Circular Chromosome Conformation Capture (4C-seq)
DOI:

09:06 min

October 05, 2018

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Chapters

  • 00:04Title
  • 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
  • 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
  • 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
  • 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
  • 08:29Conclusion

Summary

Automatic Translation

Die Kennung der physikalischen Wechselwirkungen zwischen Genen und regulatorische Elemente ist anspruchsvoll aber erfassen Bezahlungsmethode Chromosom Konformation erleichtert worden. Diese Modifikation des 4C-Seq-Protokolls mildert PCR Bias durch Minimierung der Überverstärkung PCR-Vorlagen und maximiert die Mappability von Lesevorgängen durch den Einbau eines Zusatz Restriktionsenzym verdauen Schritt.

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