Journal
/
Genetics
/
Высок объём идентификации генов регулирования последовательностей с использованием следующего поколения последовательности круговой хромосома конформации захвата (4C-seq)
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
High-throughput Identification of Gene Regulatory Sequences Using Next-generation Sequencing of Circular Chromosome Conformation Capture (4C-seq)
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Высок объём идентификации генов регулирования последовательностей с использованием следующего поколения последовательности круговой хромосома конформации захвата (4C-seq)

DOI:
10.3791/58030-v

•

09:06 min

•

October 05, 2018

•

, ,
1Division of Dermatology, Center for Pharmacogenomics, Center for the Study of Itch, Department of Medicine,Washington University School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
  • 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
  • 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
  • 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
  • 08:29Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Выявление физических взаимодействий между генов и нормативных элементов сложной но способствовала хромосома конформации захвата методами. Эта модификация 4C-seq протокол смягчает ПЦР предвзятости, сведения к минимуму чрезмерного амплификации PCR шаблонов и максимально mappability чтений путем включения добавлением энзима ограничения дайджест шаг.

Tags

4C-seqChromatin InteractionsGene Regulatory SequencesNext-generation SequencingTranscriptional RegulationPromoter-enhancer InteractionsCross-linkingRestriction DigestionCell Lysis

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Оптимизация и сравнительный анализ методов обогащения органической ДНК растений, подходящих для последующей последовательности следующего поколения

Поколения родной Chromatin иммунопреципитации секвенирования библиотек для анализа плотности нуклеосома

Высок объём идентификации наркотиков синергических сочетаний методом дублирования2

Секвенирование нового поколения и биоинформатики трубопровода для оценки генетических детерминант конституционных болезни

Усиление возле полнометражного ВИЧ-1 Proviruses для виртуализации нового поколения

Идентификация циркулярных РНК с использованием секвенирования РНК

Открытие CsgD нормативных целей в сальмонеллы Biofilm Использование хроматина иммунопреципатации и высокой пропускной способности секвенирования (ChIP-seq)

Идентификация контактов Enhancer-Promoter в эмбриоидных телах по количественному захвату конформации хромосомы (4C)

Использование секвенирования следующего поколения для выявления мутаций, связанных с восстановлением CAS9-индуцированного разрыва двойной цепи вблизи промотора CD4

Предимплантационное генетическое тестирование анеуплоидии на платформе секвенирования следующего поколения на основе полупроводников

Read Article