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Identificação do elevado-throughput de sequências de genes regulatórios utilizando a próxima geração sequenciamento de conformação Circular cromossoma capturar (4C-seq)
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
High-throughput Identification of Gene Regulatory Sequences Using Next-generation Sequencing of Circular Chromosome Conformation Capture (4C-seq)
DOI:

09:06 min

October 05, 2018

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Chapters

  • 00:04Title
  • 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
  • 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
  • 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
  • 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
  • 08:29Conclusion

Summary

Automatic Translation

A identificação das interações físicas entre genes e dos elementos reguladores é um desafio, mas tem sido facilitada pelos métodos de captura de conformação de cromossomo. Esta modificação no protocolo de 4C-seq atenua o viés PCR, minimizando a amplificação excessiva de modelos PCR e maximiza o mappability de leituras, incorporando um passo de digerir adição da enzima de restrição.

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