هنا، نقدم طريقة هضم بروتين البلازما الآلية للتحليل البروتيني الكمي القائم على الطيف الكتلي. في هذا البروتوكول ، يتم تبسيط خطوات نقل السوائل واحتضانها لتخميد البروتين ، والحد منه ، والألكيل ، وردود فعل الهضم التربسين والآلي. يستغرق ما يقرب من خمس ساعات لإعداد لوحة 96 جيدا مع الدقة المطلوبة.