Kvantitativ multiplex Immunoprecipitation (QMI) bruger flow cytometri til følsom påvisning af forskelle i den overflod af målrettede protein-protein interaktioner mellem to prøver. QMI kan udføres ved hjælp af en lille mængde biomateriale, kræver ikke genetisk manipulerede Tags, og kan tilpasses til alle tidligere definerede protein interaktion netværk.