Blod-hjerne barriere integritet er avgjørende for nervesystemet funksjon. I Drosophila melanogasterdannes blod-hjerne-barrieren av gliacellene celler i løpet av sen embryogenesis. Denne protokollen beskriver metoder for å analysen for blod-hjerne barriere dannelse og vedlikehold i D. melanogaster embryo og tredje skikkelsen larver.