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Biochemistry

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Quartäre Strukturmodellierung durch chemische Vernetzungsmassenspektrometrie
 
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Quartäre Strukturmodellierung durch chemische Vernetzungsmassenspektrometrie: Erweiterung der TX-MS Jupyter-Berichte

Article DOI: 10.3791/60311-v 05:18 min October 20th, 2021
October 20th, 2021

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Die gezielte Vernetzungsmassenspektrometrie erstellt quartäre Proteinstrukturmodelle unter Verwendung von Massenspektrometriedaten, die mit bis zu drei verschiedenen Erfassungsprotokollen erfasst wurden. Wenn sie als vereinfachter Workflow auf dem Cheetah-MS-Webserver ausgeführt werden, werden die Ergebnisse in einem Jupyter Notebook gemeldet. Hier zeigen wir die technischen Aspekte, wie das Jupyter Notebook für eine tiefergehende Analyse erweitert werden kann.

Tags

Biochemie Ausgabe 176 Protein-Protein-Interaktionen Wirt-Pathogen-Interaktionen chemische Vernetzungsmassenspektrometrie Protein-Docking Proteinstrukturmodellierung Jupyter-Notebooks
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