ספקטרומטריית מסה חוצה-קישור ממוקדת יוצרת מודלים של מבנה חלבונים רבעוניים באמצעות נתוני ספקטרומטריית מסה שנרכשו באמצעות עד שלושה פרוטוקולי רכישה שונים. כאשר התוצאות מבוצעות כזרימת עבודה פשוטה יותר בשרת האינטרנט של צ'יטה-MS, התוצאות מדווחות במחברת Jupyter. כאן, אנו מדגימים את ההיבטים הטכניים של האופן שבו ניתן להרחיב את מחברת Jupyter לניתוח מעמיק יותר.