Journal
/
/
מידול מבנה רבעוני באמצעות ספקטרומטריית מסה מצטלבת כימית: הרחבת דוחות TX-MS Jupyter
JoVE Journal
Biochemistry
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
Quaternary Structure Modeling Through Chemical Cross-Linking Mass Spectrometry: Extending TX-MS Jupyter Reports
DOI:

05:18 min

October 20, 2021

, ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
  • 02:21JupyterHub Installation
  • 02:51Report Download
  • 03:30Report Extension and Uploading
  • 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
  • 04:18Conclusion

Summary

Automatic Translation

ספקטרומטריית מסה חוצה-קישור ממוקדת יוצרת מודלים של מבנה חלבונים רבעוניים באמצעות נתוני ספקטרומטריית מסה שנרכשו באמצעות עד שלושה פרוטוקולי רכישה שונים. כאשר התוצאות מבוצעות כזרימת עבודה פשוטה יותר בשרת האינטרנט של צ'יטה-MS, התוצאות מדווחות במחברת Jupyter. כאן, אנו מדגימים את ההיבטים הטכניים של האופן שבו ניתן להרחיב את מחברת Jupyter לניתוח מעמיק יותר.

Related Videos

Read Article