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化学架橋質量分析による第四次構造モデリング:TX-MSジュピターレポートの拡張
JoVE Journal
Biochemistry
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JoVE Journal Biochemistry
Quaternary Structure Modeling Through Chemical Cross-Linking Mass Spectrometry: Extending TX-MS Jupyter Reports
DOI:

05:18 min

October 20, 2021

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
  • 02:21JupyterHub Installation
  • 02:51Report Download
  • 03:30Report Extension and Uploading
  • 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
  • 04:18Conclusion

Summary

Automatic Translation

標的架橋質量分析は、最大3つの異なる取得プロトコルを使用して取得した質量分析データを使用して、第4級タンパク質構造モデルを作成します。Cheetah-MS Webサーバーで簡略化されたワークフローとして実行すると、結果はJupyter Notebookに報告されます。ここでは、Jupyter ノートブックを拡張してより詳細な分析を行う方法の技術的な側面を示します。

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