/
/
Kvartær strukturmodellering gjennom kjemisk krysskobling av massespektrometri: Utvide TX-MS Jupyter-rapporter
This content is Free Access.
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
Chapters
- 00:04Introduction
- 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
- 02:21JupyterHub Installation
- 02:51Report Download
- 03:30Report Extension and Uploading
- 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
- 04:18Conclusion
Målrettet krysskobling av massespektrometri skaper kvartære proteinstrukturmodeller ved hjelp av massespektrometridata som er samlet inn ved hjelp av opptil tre forskjellige anskaffelsesprotokoller. Når resultatene utføres som en forenklet arbeidsflyt på Cheetah-MS-webserveren, rapporteres de i en Jupyter Notebook. Her demonstrerer vi de tekniske aspektene ved hvordan Jupyter Notebook kan utvides for en mer dyptgående analyse.
