/
/
Kvartär strukturmodellering genom kemisk tvärbindning av masspektrometri: Utvidgning av TX-MS Jupyter-rapporter
This content is Free Access.
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
Chapters
- 00:04Introduction
- 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
- 02:21JupyterHub Installation
- 02:51Report Download
- 03:30Report Extension and Uploading
- 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
- 04:18Conclusion
Riktad tvärbindning av masspektrometri skapar kvartära proteinstrukturmodeller med hjälp av masspektrometridata som förvärvats med upp till tre olika förvärvsprotokoll. När resultatet körs som ett förenklat arbetsflöde på Cheetah-MS-webbservern rapporteras de i en Jupyter Notebook. Här visar vi de tekniska aspekterna av hur Jupyter Notebook kan utökas för en mer djupgående analys.
