I denne protokollen presenterer vi en eksperimentell design ved hjelp av et betinget knockdown-system og en tilpasset sfæreformasjonsanalyse for å studere effekten av clusterin på stemness av pasientavledede GCSCer. Protokollen kan enkelt tilpasses for å studere både in vitro og in vivo funksjon av stemness-assosierte gener i ulike typer CSCer.