Üç boyutlu (3D) çok renkli floresan mikroskopi görüntülerinde kromatik kaymaların düzeltilmesi nicel veri analizleri için çok önemlidir. Bu protokol, uygun referans görüntülerin edinimi ve açık kaynak yazılım, Chromagnonile işleme yoluyla biyolojik numunelerde kromatik kaymaları ölçmek ve düzeltmek için geliştirilmiştir.