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Traduire la purification de l’affinité ribosome (TRAP) pour étudier le développement de la racine d’Arabidopsis thaliana à une échelle spécifique au type cellulaire
JoVE Journal
Developmental Biology
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JoVE Journal Developmental Biology
Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) to Investigate Arabidopsis thaliana Root Development at a Cell Type-Specific Scale
DOI:

09:41 min

May 14, 2020

, ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:08Propagation and Sterilization
  • 01:36Plating
  • 02:20Tissue Treatment (Optional)
  • 02:51Harvesting
  • 03:39Tissue Grinding and Homogenization
  • 04:39Total RNA Sample Collection, Crude Extract Clearing, Bead Washing
  • 05:34Immunoprecipitation
  • 06:49Lab Supply Reconditioning
  • 07:38Results: Representative Cell Type-Specific GFP Expression and Translational Ribosome Affinity Purification (TRAP)/Polysome RNA Quality Assessment
  • 08:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

La traduction de la purification de l’affinité ribosome (TRAP) offre la possibilité de disséquer les programmes de développement avec un traitement minimal des organes et des tissus. Le protocole donne de l’ARN de haute qualité à partir de cellules ciblées avec un sous-unité ribosomal étiquetée protéine fluorescente verte (GFP). Les outils d’analyse en aval, tels que qRT-PCR ou ARN-seq, révèlent des profils d’expression spécifiques aux tissus et aux cellules.

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