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Traducción de la purificación de afinidad de ribosoma (TRAP) para investigar el desarrollo de la raíz de Arabidopsis thaliana a una escala específica de tipo de célula
JoVE Journal
Developmental Biology
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JoVE Journal Developmental Biology
Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) to Investigate Arabidopsis thaliana Root Development at a Cell Type-Specific Scale
DOI:

09:41 min

May 14, 2020

, ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:08Propagation and Sterilization
  • 01:36Plating
  • 02:20Tissue Treatment (Optional)
  • 02:51Harvesting
  • 03:39Tissue Grinding and Homogenization
  • 04:39Total RNA Sample Collection, Crude Extract Clearing, Bead Washing
  • 05:34Immunoprecipitation
  • 06:49Lab Supply Reconditioning
  • 07:38Results: Representative Cell Type-Specific GFP Expression and Translational Ribosome Affinity Purification (TRAP)/Polysome RNA Quality Assessment
  • 08:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

La traducción de la purificación de afinidad ribosoma (TRAP) ofrece la posibilidad de diseccionar programas de desarrollo con un procesamiento mínimo de órganos y tejidos. El protocolo produce ARN de alta calidad a partir de células dirigidas con una subunidad ribosomal etiquetada con proteína fluorescente verde (GFP). Las herramientas de análisis aguas abajo, como qRT-PCR o RNA-seq, revelan perfiles de expresión específicos del tejido y del tipo de célula.

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