Journal
/
/
Substructuur Analyzer: Een gebruiksvriendelijke workflow voor snelle verkenning en nauwkeurige analyse van cellulaire lichamen in fluorescentiemicroscopie beelden
JoVE Journal
Bioengineering
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Bioengineering
Substructure Analyzer: A User-Friendly Workflow for Rapid Exploration and Accurate Analysis of Cellular Bodies in Fluorescence Microscopy Images
DOI:

14:28 min

July 15, 2020

, , , , , ,

Chapters

  • 00:00Introduction
  • 01:06Download Icy and the “Substructure Analyzer” Protocol on Icy Website
  • 01:30Opening the Protocol
  • 02:03Interacting with the Workflow on Icy
  • 02:49Merging of the Channels of an Image
  • 04:57Segmentation of the Regions of Interest
  • 07:42Fluorescent Signal Detection and Analysis
  • 09:25Run the Protocol
  • 10:35Representative Results
  • 13:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

We presenteren een vrij beschikbare workflow gebouwd voor snelle verkenning en nauwkeurige analyse van cellulaire lichamen in specifieke celcompartimenten in fluorescentiemicroscopie beelden. Deze gebruiksvriendelijke workflow is ontworpen op de open-source software Icy en maakt ook gebruik van ImageJ functionaliteiten. De pijplijn is betaalbaar zonder kennis van beeldanalyse.

Related Videos

Read Article