Здесь представлен протокол для лазерного захвата микродиссекции (LCM) тканей растений. LCM является микроскопическим методом для изоляции областей ткани в без загрязнения образом. Процедура включает фиксацию тканей, встраивание парафина, секциоирование, LCM и экстракцию РНК. РНК используется в ниже по течению ткани конкретных, временно решенный анализ транскриптомов.