Infeksjon av neonatal mus med bioluminescerende E. coli O1:K1:H7 resulterer i en septisk infeksjon med betydelig lungebetennelse og lungepatologi. Her beskriver vi prosedyrer for å modellere og videre studere neonatal sepsis ved hjelp av langsgående intravital avbildning parallelt med opplisting av systemiske bakterielle byrder, inflammatorisk profilering og lunge histopatologi.