In vivo mikroskopisk kalsiumavbildning er et uvurderlig verktøy som muliggjør sanntidsovervåking av nevronale aktiviteter hos fritt oppfører seg dyr. Det har imidlertid vært vanskelig å bruke denne teknikken på amygdala. Denne protokollen tar sikte på å gi en nyttig retningslinje for vellykket målretting av amygdala celler med et miniatyrisert mikroskop hos mus.