القوة الذرية المجهرية الأشعة تحت الحمراء الطيف (AFM-IR) يوفر منصة قوية للدراسات البكتيرية، مما يتيح تحقيق دقة النانو. ويمكن إجراء كل من رسم خرائط للتغيرات دون الخلوية (على سبيل المثال، عند انقسام الخلايا) وكذلك الدراسات المقارنة للتركيب الكيميائي (على سبيل المثال، الناشئة عن مقاومة الأدوية) على مستوى خلية واحدة في البكتيريا.