Journal
/
/
Proteomic Profil af EPS-Urin gennem FASP Fordøjelse og data-uafhængig analyse
JoVE Journal
Biochemistry
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
Proteomic Profile of EPS-Urine through FASP Digestion and Data-Independent Analysis
DOI:

14:48 min

May 08, 2021

, , , , , , ,

Chapters

  • 00:00Introduction
  • 00:55Protocol
  • 01:25Protocol: FASP Digestion
  • 05:29Protocol: SCX Purification
  • 08:08Protocol: Protein Quantifcation by External Standard
  • 09:23Protocol: NanoLC-MS/MS and DIA Analysis
  • 11:31Protocol: High-pH C18 Fractionation for Spectral Library
  • 13:09Protocol: Data Analysis
  • 13:35Expected Results
  • 13:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Her præsenterer vi en optimeret in-filter fordøjelsesprotokol med detaljerede oplysninger om følgende: protein fordøjelse, peptidrensning og data uafhængig erhvervelse analyse. Denne strategi anvendes til analyse af udtrykte prostatiske sekreter-urinprøver og giver mulighed for høj proteom dækning og lav manglende værdi etiket-fri profilering af urin proteome.

Related Videos

Read Article