Dit protocol introduceert stappen van metabarcoding-analyse, gericht op 16S rRNA- en 18S-rRNA-genen, voor het monitoren van schadelijke algenbloei en hun bijbehorende microbioom in zeewatermonsters. Het is een krachtig moleculair gebaseerd hulpmiddel, maar vereist verschillende procedures, die hier stap voor stap visueel worden uitgelegd.