Bu protokol, deniz suyu örneklerinde zararlı alg çiçeklerini ve ilişkili mikrobiyomlarını izlemek için 16S rRNA ve 18S rRNA genlerini hedefleyen metabarkodlama analizi adımlarını tanıtır. Güçlü bir moleküler tabanlı araçtır, ancak burada adım adım görsel olarak açıklanan çeşitli prosedürler gerektirir.